15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0005 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  477  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0418  hypothetical protein  30.41 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3136  hypothetical protein  31.47 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2684  HNH nuclease  28.37 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0200  hypothetical protein  27.69 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3669  hypothetical protein  32.2 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775009  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3726  hypothetical protein  29.55 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2490  hypothetical protein  27.84 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  27.59 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4120  hypothetical protein  28.46 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5114  hypothetical protein  28.24 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3356  hypothetical protein  28.19 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4525  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148473  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0741  hypothetical protein  31.82 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  23.65 
 
 		 269 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>