243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0251 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3381  flagellar motor switch protein G  99.11 
 
 
336 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0251  flagellar motor switch protein G  100 
 
 
336 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0233  flagellar motor switch protein G  68.37 
 
 
347 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0632  flagellar motor switch protein G  68.37 
 
 
347 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0712  flagellar motor switch protein G  68.37 
 
 
347 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4416  flagellar motor switch protein FliG  54.55 
 
 
354 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.202988 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04974  flagellar motor switch protein G  45.35 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0224  flagellar motor switch protein G  42.9 
 
 
337 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0172  flagellar motor switch protein G  42.9 
 
 
337 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0076  flagellar motor switch protein G  44.64 
 
 
337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0082  flagellar motor switch protein G  43.75 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3978  flagellar motor switch protein G  45.17 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001187  flagellar motor switch protein FliG  44.41 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3475  flagellar motor switch protein G  44.86 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3658  flagellar motor switch protein G  43.6 
 
 
338 aa  269  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4656  flagellar motor switch protein G  40.8 
 
 
350 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.508113  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3564  flagellar motor switch protein G  37.31 
 
 
350 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  35.87 
 
 
338 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  36.36 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  34.8 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  34.8 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  34.8 
 
 
339 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  33.86 
 
 
339 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  34.17 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  32.91 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  34.48 
 
 
339 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  33.13 
 
 
338 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  33.86 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  31.33 
 
 
334 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  31.64 
 
 
337 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  34.07 
 
 
334 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  31.37 
 
 
351 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  30.38 
 
 
350 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  32.81 
 
 
329 aa  159  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  30.75 
 
 
351 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  32.49 
 
 
329 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  31.86 
 
 
346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  31.33 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  32.22 
 
 
337 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
337 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  31.96 
 
 
351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  32.6 
 
 
331 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  32.92 
 
 
331 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  32.93 
 
 
331 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  31.96 
 
 
348 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1288  flagellar motor switch protein FliG  31.71 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.392476  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  31.96 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2948  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  29.43 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  31.66 
 
 
345 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  31.06 
 
 
350 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  31.06 
 
 
350 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  31.06 
 
 
350 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  31.06 
 
 
348 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  31.06 
 
 
348 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  31.03 
 
 
349 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  31.06 
 
 
350 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  30.75 
 
 
348 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  31.23 
 
 
351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  32.71 
 
 
331 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  30.53 
 
 
331 aa  145  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
330 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
330 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
330 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  30.75 
 
 
348 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  30.75 
 
 
348 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 
336 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 
336 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  30.25 
 
 
347 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  31.46 
 
 
331 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  30.12 
 
 
339 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  32.8 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  30.91 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  30.7 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  30.58 
 
 
333 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  30.25 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  29.94 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  31.11 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  29.23 
 
 
340 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  30.84 
 
 
331 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  29.23 
 
 
340 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  28.57 
 
 
338 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  31.31 
 
 
335 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  30.82 
 
 
333 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  31.31 
 
 
335 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1441  flagellar motor switch protein FliG  30.28 
 
 
339 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  28.1 
 
 
336 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  32.5 
 
 
336 aa  136  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  30.48 
 
 
342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2530  flagellar motor switch protein G  31.68 
 
 
333 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  32.18 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  30.91 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  30.91 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2451  flagellar motor switch protein G  32.1 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00544517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  30.91 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  30.91 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>