More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4762 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4762  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  100 
 
 
247 aa  507  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240118 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03298  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  98.38 
 
 
247 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.96147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3727  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  97.98 
 
 
247 aa  500  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03251  hypothetical protein  98.38 
 
 
247 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.957517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0267  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  98.38 
 
 
247 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0866161  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0266  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  97.17 
 
 
247 aa  497  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3875  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  97.98 
 
 
247 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3646  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  97.98 
 
 
247 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3926  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  97.17 
 
 
247 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3744  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  87.3 
 
 
246 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3924  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  87.3 
 
 
246 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3852  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  85.83 
 
 
249 aa  421  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.866919 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3755  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  87.3 
 
 
246 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3822  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  87.3 
 
 
246 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3865  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  86.48 
 
 
246 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0238  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  72.84 
 
 
249 aa  371  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0129  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  73.97 
 
 
249 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4041  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  75.41 
 
 
247 aa  362  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0121  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  73.55 
 
 
249 aa  362  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3651  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  73.36 
 
 
249 aa  359  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.652029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3857  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  74.49 
 
 
248 aa  357  7e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3958  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  72.95 
 
 
249 aa  345  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0262456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0260  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  72.95 
 
 
249 aa  345  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0220  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  55.51 
 
 
254 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2740  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  57.72 
 
 
253 aa  273  2e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3213  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  57.72 
 
 
253 aa  273  2e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2790  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  57.72 
 
 
253 aa  273  2e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3751  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  57.72 
 
 
253 aa  273  2e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3721  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  57.72 
 
 
253 aa  273  2e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.694044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1764  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  57.72 
 
 
253 aa  273  2e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3017  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  57.85 
 
 
253 aa  272  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3693  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  57.32 
 
 
253 aa  271  8e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4202  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  55.23 
 
 
261 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0513  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  56.25 
 
 
262 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0327  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  55.74 
 
 
254 aa  265  3e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.749062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0318  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  55.33 
 
 
254 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0302  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  55.74 
 
 
258 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.640892  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3496  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  55.33 
 
 
256 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0378  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  54.73 
 
 
256 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0399  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  54.32 
 
 
256 aa  254  1e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2708  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  54.32 
 
 
256 aa  254  1e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116697  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2051  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  52.46 
 
 
245 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2048  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  51.65 
 
 
255 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4138  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.03 
 
 
249 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0853  glycerophosphodiester phosphodiesterase  54.58 
 
 
247 aa  239  3e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0858  glycerophosphodiester phosphodiesterase  51.24 
 
 
249 aa  234  1e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0787  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  51.24 
 
 
249 aa  234  1e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1096  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  51.03 
 
 
250 aa  233  2e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223987  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  51.03 
 
 
250 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3655  glycerophosphodiester phosphodiesterase  50.42 
 
 
253 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0749  glycerophosphodiester phosphodiesterase  51.65 
 
 
257 aa  220  1e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.620418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2739  glycerophosphodiester phosphodiesterase  49.15 
 
 
249 aa  220  1e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.209911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1283  glycerophosphodiester phosphodiesterase  49.6 
 
 
261 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1268  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  50.41 
 
 
252 aa  214  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1306  glycerophosphodiester phosphodiesterase  46 
 
 
293 aa  213  3e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5469  glycerophosphodiester phosphodiesterase  44.94 
 
 
254 aa  211  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3305  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  41.56 
 
 
247 aa  197  1e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233023  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2228  hypothetical protein  42.74 
 
 
239 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2200  hypothetical protein  42.31 
 
 
239 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1701  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.13 
 
 
242 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0157713  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0756  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.09 
 
 
244 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.997295  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0653  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.09 
 
 
250 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.84 
 
 
250 aa  148  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0027  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.02 
 
 
247 aa  147  2e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0027  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.02 
 
 
247 aa  147  2e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2523  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase UgpQ, putative  35.02 
 
 
247 aa  147  2e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0212323  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3786  glycerophosphodiester phosphodiesterase  40.33 
 
 
291 aa  145  4e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.35 
 
 
250 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0608  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.14 
 
 
257 aa  131  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46198e-06 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.29 
 
 
266 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0337  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.9 
 
 
245 aa  129  4e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0220885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  32.07 
 
 
253 aa  127  1e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1875  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.58 
 
 
254 aa  127  1e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4506  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.07 
 
 
253 aa  127  2e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.62 
 
 
252 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.75 
 
 
249 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0893  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.79 
 
 
245 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  0.0736212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.23 
 
 
320 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.62 
 
 
241 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.04 
 
 
235 aa  122  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.04 
 
 
241 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.04 
 
 
241 aa  118  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  33.04 
 
 
241 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.61 
 
 
241 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.04 
 
 
241 aa  116  4e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  33.77 
 
 
241 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.96 
 
 
231 aa  115  7e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.33 
 
 
241 aa  114  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.87 
 
 
243 aa  114  1e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.95679e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.77 
 
 
241 aa  114  1e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.77 
 
 
241 aa  114  2e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.63 
 
 
250 aa  113  2e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31 
 
 
224 aa  114  2e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.77 
 
 
241 aa  114  2e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3495  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.12 
 
 
247 aa  111  1e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.45 
 
 
299 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.05 
 
 
631 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  30.34 
 
 
248 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000464019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  33.48 
 
 
241 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.11179e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.72 
 
 
233 aa  105  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>