More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0083 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
93 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  87.1 
 
 
93 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.03026e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  85.71 
 
 
94 aa  169  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  81.11 
 
 
90 aa  159  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.59778e-07  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  86.75 
 
 
93 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  82.22 
 
 
90 aa  157  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  79.55 
 
 
89 aa  154  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  76.34 
 
 
92 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 
91 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.53887e-05  unclonable  3.38266e-12 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  79.07 
 
 
95 aa  147  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 
91 aa  147  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  7.24937e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  73.12 
 
 
92 aa  147  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  79.07 
 
 
93 aa  144  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.77682e-06  hitchhiker  1.20384e-09 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  144  4e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  72.22 
 
 
90 aa  144  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  2.30352e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  71.74 
 
 
92 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.20584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  143  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.02796e-06  unclonable  7.23515e-06 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  143  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0841  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
91 aa  143  7e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  75.56 
 
 
91 aa  143  7e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 
95 aa  143  7e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08890  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
91 aa  143  7e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  143  8e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.43627e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  143  8e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.09471e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  143  8e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.35387e-09  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.35385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  79.07 
 
 
93 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  6.07565e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  8.77043e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4745  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00116021  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0458  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  1.66272e-07 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.95023e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0488  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  71.11 
 
 
91 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.39134e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  142  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0491  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  2.57867e-06  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  1.16532e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  4.3477e-06  hitchhiker  6.13779e-06 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
91 aa  141  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.91736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.19443e-05  unclonable  1.54128e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.08032e-09  hitchhiker  1.25391e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.2398e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.52177e-06  unclonable  4.39739e-11 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.86112e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.00624e-06  unclonable  5.33461e-12 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.47318e-05  unclonable  8.36266e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.85402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.60903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  1.51604e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56834e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  68.82 
 
 
93 aa  140  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2165  ribosomal protein S19  74.44 
 
 
90 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00915684  normal  0.130063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  70 
 
 
91 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.19027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3905  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296371  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  140  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.28304e-05  decreased coverage  4.75067e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 
91 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
91 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  7.61945e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  71.11 
 
 
91 aa  140  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
91 aa  140  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
91 aa  139  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
91 aa  139  1e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  4.53521e-06  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 
93 aa  139  1e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.87656e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 
93 aa  139  1e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39735e-15 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  71.11 
 
 
91 aa  139  1e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.9413e-08  hitchhiker  1.61799e-06 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  138  2e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  8.6131e-07 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  69.57 
 
 
92 aa  138  2e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.92272e-05  hitchhiker  7.72184e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 
93 aa  138  2e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.20025e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  68.89 
 
 
90 aa  138  2e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.62124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  139  2e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  7.16821e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
91 aa  139  2e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  5.05191e-06  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5075  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
91 aa  138  2e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.15365e-07  normal  0.273051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
90 aa  138  2e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
91 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.70652e-15  unclonable  3.67695e-08 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.48079e-06  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  8.04319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  6.94495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.90611e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  4.42981e-11  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  2.95141e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  2.07611e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  2.18247e-06  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  4.07777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  9.27803e-08  hitchhiker  1.50693e-11 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  4.03295e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.90482e-09  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  137  4e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.65315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
91 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  1.11628e-06 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  66.3 
 
 
92 aa  137  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0331  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
91 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.782912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
91 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  9.87549e-06  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 
98 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>