35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0070 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
335 aa  677  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  85.89 
 
 
334 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  77.71 
 
 
334 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  62.62 
 
 
332 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  61.89 
 
 
330 aa  397  1e-110  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  58.15 
 
 
330 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.53702e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  54.13 
 
 
333 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  59.29 
 
 
337 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  61.69 
 
 
339 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  52.96 
 
 
331 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  53.73 
 
 
342 aa  355  9e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  51.99 
 
 
331 aa  349  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  52.94 
 
 
331 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  50.77 
 
 
331 aa  337  2e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  49.54 
 
 
331 aa  335  6e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  50 
 
 
331 aa  326  4e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  49.85 
 
 
332 aa  321  8e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  33.58 
 
 
233 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.06057e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  37.36 
 
 
244 aa  131  2e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  36.88 
 
 
249 aa  129  7e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  34.33 
 
 
248 aa  122  1e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  33.1 
 
 
255 aa  116  7e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  31.09 
 
 
289 aa  67  5e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  32.22 
 
 
255 aa  64.7  2e-09  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  29.96 
 
 
255 aa  63.9  4e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  32.39 
 
 
256 aa  62  1e-08  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  27.17 
 
 
220 aa  62  1e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  27.69 
 
 
271 aa  59.7  6e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  29.66 
 
 
254 aa  56.2  8e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  22.3 
 
 
277 aa  53.1  6e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.27 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  25.9 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  24.58 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  22.66 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.77 
 
 
254 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>