More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3056 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3056  ABC transporter related  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2017  ABC transporter related  64.29 
 
 		 224 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3498  ABC transporter related  62.67 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.552315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0478  ABC transporter related  61.78 
 
 		 225 aa  277  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0733  cell division ATP-binding protein FtsE  62.78 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2387  ABC transporter related  62.33 
 
 		 223 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.41405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2451  ABC transporter related  60.09 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16471  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2374  cell division ATP-binding protein FtsE  50.45 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.195215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3572  cell division ATP-binding protein FtsE  49.77 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  0.091896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0022  cell division ATP-binding protein FtsE  49.77 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.640793  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3865  cell division ATP-binding protein FtsE  48.86 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1595  cell division ATP-binding protein FtsE  53.69 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0984  cell division ATP-binding protein FtsE  49.26 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1997  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  49.51 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  49.51 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2892  ABC transporter related  48.2 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.688447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0100  cell division ATP-binding protein FtsE  46.08 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3013  cell division ATP-binding protein FtsE  48 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4027  cell division ATP-binding protein  51.37 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3084  cell division ATP-binding protein FtsE  48.04 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1176  cell division ABC transpoter ATP-binding protein  50 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3217  cell division ATP-binding protein FtsE  49.32 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11249  normal  0.222957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0701  ABC transporter related  47.06 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0362  cell division ATP-binding protein FtsE  50 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3091  cell division ATP-binding protein FtsE  50.91 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2543  cell division ATP-binding protein FtsE  47.95 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772851  normal  0.715925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5218  cell division ATP-binding protein FtsE  50 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0943  ABC transporter related  49.09 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3254  ABC transporter component  49.27 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0834  ABC transporter related  48.64 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.389037  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1154  cell division ATP-binding protein FtsE  49 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2195  cell division ATP-binding protein FtsE  49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204033  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3089  cell division ATP-binding protein FtsE  46.19 
 
 		 237 aa  184  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29144  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2983  cell division ATP-binding protein FtsE  47.09 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2863  cell division ATP-binding protein FtsE  46.19 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2518  cell division ATP-binding protein FtsE  46.36 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4867  ABC transporter related  50.45 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.459104  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0576  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0667  ABC transporter related  50.45 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0394716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2980  cell division ATP-binding protein FtsE  48.5 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  41.36 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07700  cell division ATP-binding protein FtsE  42.01 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2478  cell division ATP-binding protein FtsE  40.91 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.831183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  40.91 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0793  cell division ATP-binding protein FtsE  40.91 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.475778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  41.74 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.402679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1611  cell division ATP-binding protein FtsE  42.27 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1636  cell division ATP-binding protein FtsE  42.27 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1582  cell division ATP-binding protein FtsE  42.27 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1453  cell-division ATP-binding protein  40.91 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  39.73 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0578  ATPase  38.35 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0490127  normal  0.247992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1914  type II secretory pathway family protein  40.91 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  43.5 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  41.87 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  41.38 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  37.44 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1035  cell division ATP-binding protein FtsE  40.37 
 
 		 333 aa  154  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3781  cell division ATP-binding protein FtsE  42.2 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1268  cell division ATP-binding protein FtsE  41.28 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13119  cell division ATP-binding protein ftsE  40.91 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.762863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1234  cell division ATP-binding protein FtsE  40 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1650  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0762596  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0540  ABC transporter related  36.89 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00247085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0945  cell division ATP-binding protein FtsE  41.79 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5034  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  35.91 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4864  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1407  cell division ATP-binding protein FtsE  40.45 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0924913  normal  0.397087 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1781  cell division ATP-binding protein FtsE  36.32 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.14805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1444  ATPase  37.1 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4006  cell division ATP-binding protein FtsE  41.29 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2913  cell division ATP-binding protein FtsE  41 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  35.91 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0245  hypothetical protein  38.59 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1866  cell division ATP-binding protein FtsE  36.36 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0534138  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5302  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  35.45 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  39.11 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1932  cell division ATP-binding protein FtsE  42.86 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5290  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  35.45 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1761  cell division ATP-binding protein FtsE  38.91 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3072  ABC transporter related  43.78 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134895  hitchhiker  0.0099373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4448  type II secretory pathway family protein  40 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4742  cell division ATP-binding protein FtsE  40.39 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4879  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0717  ABC transporter related  38.35 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0864  cell division ATP-binding protein FtsE  39.55 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1205  cell division ATP-binding protein FtsE  40.1 
 
 		 248 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5416  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  36.45 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3022  cell division ATP-binding protein FtsE  40.3 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.94484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5272  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  36.45 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.995726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0918  cell division ATP-binding protein FtsE  36.82 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.593583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1244  cell division ATP-binding protein FtsE  40 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25190  cell division ATP-binding protein FtsE  39.55 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.661516  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03312  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.89 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0252  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  41.89 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3945  cell division protein FtsE  41.89 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3662  cell division protein FtsE  41.89 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3859  cell division protein FtsE  41.89 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03265  hypothetical protein  41.89 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>