More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0734 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 130 aa  263  7e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  70 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 		 130 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 		 130 aa  193  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  66.92 
 
 		 130 aa  190  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  68.46 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  62.9 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  159  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  62.31 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 130 aa  157  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  56.92 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 		 130 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 		 130 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 		 130 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 131 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 159 aa  154  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2703  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  57.69 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  61.29 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0647  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3766  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0197  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0680  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  58.78 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0600  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000648007  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0574  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1234  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  62.4 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0491  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0372353  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  62.4 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3451  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0078135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 155 aa  150  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2563  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  57.48 
 
 		 133 aa  150  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  59.06 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0608  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451686  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3353  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507288  hitchhiker  0.0000404008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>