More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3102 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
361 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  59.39 
 
 
366 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  55.39 
 
 
353 aa  360  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  50.3 
 
 
349 aa  315  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  48.07 
 
 
371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  50.17 
 
 
312 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  44.12 
 
 
351 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  45.03 
 
 
360 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.66 
 
 
357 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.37 
 
 
353 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.37 
 
 
357 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  45.1 
 
 
354 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  42.38 
 
 
357 aa  275  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.94 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.94 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  42.94 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  42.94 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  42.37 
 
 
357 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.09 
 
 
357 aa  269  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.09 
 
 
357 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  47.94 
 
 
354 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  39.83 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  40.67 
 
 
762 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 
495 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  43.15 
 
 
496 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  39.65 
 
 
351 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  39.65 
 
 
351 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  41.14 
 
 
376 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.88 
 
 
359 aa  219  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  35.31 
 
 
326 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 
521 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  36.08 
 
 
391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  39.37 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  35.04 
 
 
441 aa  209  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  38.68 
 
 
386 aa  206  7e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  39.32 
 
 
348 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  35.96 
 
 
319 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  38.06 
 
 
357 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.65 
 
 
319 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  36.68 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  38.04 
 
 
340 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.09 
 
 
387 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 
348 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
369 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.01 
 
 
321 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  36.34 
 
 
355 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.14 
 
 
491 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  37.74 
 
 
349 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  36.66 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  34.6 
 
 
554 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  37.5 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  35.57 
 
 
425 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 
542 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
372 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  35.06 
 
 
340 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
360 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  33.83 
 
 
551 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  38.46 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  35.22 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.83 
 
 
416 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  35.35 
 
 
317 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2516  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.69 
 
 
370 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
545 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  36.94 
 
 
404 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  35.03 
 
 
330 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2395  family 4 glycosyl transferase  35.76 
 
 
372 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  29.47 
 
 
360 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 
369 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1209  glycosyl transferase family 4  32.76 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  34.12 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 
405 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.73 
 
 
427 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  35.83 
 
 
364 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  35.83 
 
 
364 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  32.82 
 
 
393 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  33.43 
 
 
382 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  33.05 
 
 
375 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  37.03 
 
 
333 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1014  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
369 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.258485  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
380 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.93 
 
 
403 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2416  putative teichoic acid linkage unit synthesis (synthesis of undecaprenylpyrophosphate-N-aetylglucosamine )  33.96 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  29.7 
 
 
352 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 
336 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3716  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
369 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0891  family 4 glycosyl transferase  33.33 
 
 
402 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6145  glycosyl transferase family 4  35.03 
 
 
389 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  30.16 
 
 
437 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2310  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
405 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.440148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1261  glycosyl transferase family 4  32.23 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.644979  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  33.63 
 
 
367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.54 
 
 
600 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1295  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
403 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.025134  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1290  glycosyl transferase family 4  35.34 
 
 
372 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2456  glycosyl transferase family 4  34.48 
 
 
399 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  31.37 
 
 
367 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2090  putative glycosyltransferase  34.52 
 
 
364 aa  142  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>