More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0467 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  100 
 
 
434 aa  889  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.74021e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  43.6 
 
 
431 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  37.59 
 
 
428 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  38.98 
 
 
429 aa  282  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  41.51 
 
 
424 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  38.43 
 
 
459 aa  270  3e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  37.92 
 
 
435 aa  269  6e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  39.58 
 
 
447 aa  269  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  41.2 
 
 
424 aa  269  9e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  40.55 
 
 
427 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  40.37 
 
 
440 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  36.55 
 
 
431 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  40.48 
 
 
422 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  36.6 
 
 
435 aa  259  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  36.6 
 
 
437 aa  259  9e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  40.19 
 
 
424 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  39.9 
 
 
424 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  35.24 
 
 
433 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  38.2 
 
 
431 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  35.85 
 
 
424 aa  255  1e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  35.81 
 
 
433 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.1 
 
 
433 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  34.55 
 
 
433 aa  253  5e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  36.53 
 
 
429 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  34.1 
 
 
433 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  34.1 
 
 
433 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  34.1 
 
 
433 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 
424 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.1 
 
 
433 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  34.1 
 
 
433 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.1 
 
 
427 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  38.11 
 
 
431 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.32 
 
 
433 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.87 
 
 
433 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 
453 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.69 
 
 
425 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  34.45 
 
 
422 aa  246  5e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  36.67 
 
 
457 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.37038e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  40.64 
 
 
426 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  35.46 
 
 
454 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  34.13 
 
 
441 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  37.47 
 
 
439 aa  239  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  37.06 
 
 
428 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  34.79 
 
 
432 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.43 
 
 
466 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  33.89 
 
 
441 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  37.94 
 
 
437 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  34.52 
 
 
438 aa  236  5e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  34.91 
 
 
451 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  36.87 
 
 
437 aa  236  6e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
465 aa  235  1e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  37.56 
 
 
438 aa  235  1e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.54 
 
 
425 aa  234  2e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  37.56 
 
 
432 aa  233  7e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  34.92 
 
 
427 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  36.51 
 
 
428 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  36.64 
 
 
436 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  37.19 
 
 
429 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.23 
 
 
470 aa  226  5e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  35.03 
 
 
438 aa  226  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  41.69 
 
 
403 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  39.3 
 
 
425 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  35.22 
 
 
426 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  36.1 
 
 
416 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  35.04 
 
 
410 aa  223  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  31.83 
 
 
419 aa  223  5e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  36.97 
 
 
422 aa  223  5e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  36.84 
 
 
430 aa  221  1e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  36.45 
 
 
461 aa  221  1e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  32.2 
 
 
413 aa  221  2e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  37.65 
 
 
437 aa  221  2e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  35.94 
 
 
444 aa  220  4e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  35.71 
 
 
428 aa  219  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  36.7 
 
 
438 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  39.23 
 
 
429 aa  218  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  35.68 
 
 
471 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  33.66 
 
 
443 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  37.67 
 
 
433 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  37.83 
 
 
445 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  36.38 
 
 
508 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.81 
 
 
420 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  35.8 
 
 
485 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 
438 aa  217  3e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.64 
 
 
847 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 
407 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  34.14 
 
 
416 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  34.16 
 
 
878 aa  216  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
432 aa  216  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  34.51 
 
 
817 aa  216  9e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  36.61 
 
 
440 aa  215  1e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  36.45 
 
 
421 aa  214  2e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  37.44 
 
 
435 aa  214  3e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.62 
 
 
464 aa  214  3e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
444 aa  213  5e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  34.22 
 
 
408 aa  213  5e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  36 
 
 
450 aa  212  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  35.45 
 
 
434 aa  212  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  41.67 
 
 
408 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  33.69 
 
 
435 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  37.29 
 
 
460 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>