More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0047 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
281 aa  573  1e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  75.93 
 
 
279 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  75.94 
 
 
280 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  52.87 
 
 
291 aa  278  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  48.47 
 
 
289 aa  271  8e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  51.52 
 
 
292 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  47.02 
 
 
290 aa  260  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  46.98 
 
 
284 aa  257  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  46.98 
 
 
284 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  47.97 
 
 
278 aa  254  2e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  46.49 
 
 
281 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  48.11 
 
 
308 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  47.25 
 
 
297 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.72 
 
 
281 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  47.94 
 
 
293 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.07 
 
 
283 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  46.07 
 
 
283 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  44.98 
 
 
281 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  47.74 
 
 
278 aa  245  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  46.1 
 
 
281 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  45.76 
 
 
288 aa  245  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  46.49 
 
 
290 aa  245  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  45.02 
 
 
281 aa  245  7e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  46.1 
 
 
281 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  46.99 
 
 
279 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.32 
 
 
283 aa  244  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  45.39 
 
 
281 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  45.02 
 
 
281 aa  244  1e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  45.76 
 
 
281 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  45.76 
 
 
281 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  48.95 
 
 
279 aa  243  2e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  48.95 
 
 
279 aa  243  2e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  47.97 
 
 
294 aa  244  2e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  47.17 
 
 
279 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  45.39 
 
 
281 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  45.39 
 
 
281 aa  242  4e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  48.12 
 
 
278 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  43.93 
 
 
280 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  47.58 
 
 
301 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  45.32 
 
 
281 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  46.27 
 
 
289 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  48.3 
 
 
281 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  46.13 
 
 
295 aa  239  3e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  45.04 
 
 
280 aa  239  3e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  44.74 
 
 
279 aa  239  3e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  44.57 
 
 
283 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  46.86 
 
 
292 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  46.44 
 
 
283 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  44.74 
 
 
281 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  43.91 
 
 
281 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  45.15 
 
 
284 aa  234  1e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.82 
 
 
280 aa  234  2e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  46.39 
 
 
277 aa  234  2e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  45.52 
 
 
284 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  44.61 
 
 
284 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  46.44 
 
 
280 aa  233  4e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  46.44 
 
 
335 aa  233  4e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  46.44 
 
 
317 aa  232  4e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  45.11 
 
 
280 aa  233  4e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  46.44 
 
 
280 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  46.44 
 
 
317 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  46.44 
 
 
280 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  46.44 
 
 
280 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  45.88 
 
 
280 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  46.44 
 
 
317 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  50 
 
 
286 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  50 
 
 
286 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  50 
 
 
286 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  45.39 
 
 
289 aa  232  7e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  44.4 
 
 
284 aa  231  7e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  45.35 
 
 
280 aa  231  8e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.74 
 
 
280 aa  231  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  43.87 
 
 
284 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  43.61 
 
 
285 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  49.56 
 
 
281 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  46.07 
 
 
280 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.61 
 
 
280 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  44.98 
 
 
280 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  45.16 
 
 
280 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  49.12 
 
 
280 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.17 
 
 
282 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  49.12 
 
 
280 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  43.82 
 
 
280 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  44.57 
 
 
280 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  43.87 
 
 
280 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  48.68 
 
 
286 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.09 
 
 
282 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  49.12 
 
 
281 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  42.38 
 
 
284 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  43.49 
 
 
280 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  42.38 
 
 
281 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  46.49 
 
 
284 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  40.48 
 
 
311 aa  196  4e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3717  ATPase-like protein  37.97 
 
 
331 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  39.69 
 
 
345 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2067  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.06 
 
 
318 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.96 
 
 
315 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  33.88 
 
 
294 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0899  ATPase  33.33 
 
 
360 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2060  ATPase-like protein  32.23 
 
 
330 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.598093  normal  0.848837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>