32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2085 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  61.42 
 
 
984 aa  1281    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  36.88 
 
 
1076 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  42.66 
 
 
1001 aa  690    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  39.64 
 
 
1009 aa  728    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  45.19 
 
 
993 aa  857    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  68.66 
 
 
991 aa  1410    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  100 
 
 
989 aa  2031    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  40.12 
 
 
1005 aa  790    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  37.11 
 
 
1099 aa  612  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  34.27 
 
 
1109 aa  607  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  33.59 
 
 
1103 aa  532  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  33.5 
 
 
881 aa  458  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  34.22 
 
 
947 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  35.81 
 
 
880 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  33.7 
 
 
880 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  34.47 
 
 
882 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  32.58 
 
 
875 aa  436  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  33.72 
 
 
880 aa  422  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  33.44 
 
 
881 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  35.73 
 
 
1093 aa  365  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  31.09 
 
 
619 aa  92.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  29.73 
 
 
619 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  27.27 
 
 
623 aa  82  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  28.5 
 
 
624 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  27.36 
 
 
621 aa  78.2  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  27.72 
 
 
652 aa  75.1  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  31.03 
 
 
1245 aa  73.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  29.41 
 
 
613 aa  65.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  30.81 
 
 
619 aa  65.1  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  27.36 
 
 
541 aa  50.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  23.53 
 
 
634 aa  49.7  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  26.35 
 
 
455 aa  45.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>