238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2177 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2177  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 
62 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  63.08 
 
 
79 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0399  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  75.86 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0144  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  70.97 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0448157 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1121  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  68.42 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.713448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1701  twin arginine translocase protein A  77.78 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0480463  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.02 
 
 
62 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.54 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  49.12 
 
 
57 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  81.08 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  47.54 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3167  twin arginine translocase protein A  58.33 
 
 
61 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000551363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.03 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  52.54 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3217  twin-arginine translocation protein TatA/E  66.04 
 
 
61 aa  60.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.6697199999999997e-20  hitchhiker  0.000106815 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  49.15 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  47.46 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.56 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  49.21 
 
 
59 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0132  twin arginine translocase protein A  56.67 
 
 
63 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  45.16 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3190  twin arginine-targeting protein translocase  53.23 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  47.37 
 
 
60 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  57.78 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0148  twin arginine translocase protein A  60.38 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  52.94 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  57.78 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  53.33 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.08 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.08 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.08 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0045  twin arginine translocase protein A  62 
 
 
61 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.895264  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  53.33 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 
55 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  62.5 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  50.88 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.83 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.39 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.73 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 
56 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.81 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0289  twin arginine translocase protein A  51.61 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  53.33 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  48.15 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  49.02 
 
 
57 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  35 
 
 
60 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.49 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  52.17 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3134  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.06 
 
 
55 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  53.33 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  46.3 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  40.3 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  41.94 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.7 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  50.98 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3157  twin arginine translocase protein A  47.62 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000988339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1128  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.14 
 
 
55 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  43.55 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  47.92 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2956  twin arginine translocase protein A  41.94 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3028  twin arginine translocase protein A  41.94 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1856  twin arginine translocase protein A  41.94 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000816668  normal  0.827039 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  43.48 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1174  twin arginine translocase protein A  45.31 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000428272  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  48.89 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2971  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.77 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00309368  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  48.89 
 
 
71 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1700  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.79 
 
 
56 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  47.92 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.62 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  42.62 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  42.62 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  42.62 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  42.62 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  42.62 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>