13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1709 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  291  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  30.66 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  34.53 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  26.28 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1187  PilT domain-containing protein  28.99 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  29.73 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  30 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1694  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 
147 aa  42.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000132965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1316  PilT domain-containing protein  30.94 
 
 
142 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>