229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6041 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
216 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  61.9 
 
 
201 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  61.9 
 
 
192 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  61.7 
 
 
191 aa  241  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.65 
 
 
205 aa  232  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.16 
 
 
193 aa  228  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.38 
 
 
193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  53.85 
 
 
204 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.85 
 
 
204 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.48 
 
 
192 aa  204  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
192 aa  201  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
192 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
192 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  44.44 
 
 
192 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.94 
 
 
507 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  49.48 
 
 
207 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  48.97 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.15 
 
 
507 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
191 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.27 
 
 
195 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.47 
 
 
192 aa  158  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.78 
 
 
197 aa  138  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.18 
 
 
197 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.49 
 
 
194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
193 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.1 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 
191 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.26 
 
 
191 aa  118  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.74 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.74 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 
191 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.74 
 
 
191 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.21 
 
 
191 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.15 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.21 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.74 
 
 
191 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.74 
 
 
191 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.61 
 
 
194 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.27 
 
 
218 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000199345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.55 
 
 
192 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.05 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.21 
 
 
193 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.37 
 
 
193 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.37 
 
 
193 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.37 
 
 
193 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.37 
 
 
193 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.21 
 
 
193 aa  89  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.69 
 
 
193 aa  88.2  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.79 
 
 
193 aa  88.2  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  30.61 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.8 
 
 
193 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.41 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  27.75 
 
 
189 aa  86.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.17 
 
 
233 aa  85.1  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.98 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.45 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.89 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000456035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  40.74 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.5 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.46 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.76 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.32 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  29.5 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.96 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.16 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.07 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.2 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  35.51 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.31 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  26.8 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  31.48 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.94 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0029  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  35.96 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.95 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  25.63 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.29 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  31.47 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154354  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0979  hypothetical protein  31.19 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.58351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00905  hypothetical protein  31.19 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.6 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00912  hypothetical protein  31.19 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.258125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2695  hypothetical protein  31.19 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.59295  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.92 
 
 
230 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  23.67 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.94 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
198 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>