43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0328 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  68.59 
 
 
196 aa  254  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  68.91 
 
 
193 aa  248  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  69.5 
 
 
197 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  69.5 
 
 
197 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  69.5 
 
 
197 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  61.54 
 
 
210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  62.83 
 
 
210 aa  224  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  64.74 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  63.4 
 
 
249 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  61.7 
 
 
223 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  63.5 
 
 
192 aa  195  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  57.59 
 
 
201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 
196 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  45.91 
 
 
224 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  39.58 
 
 
205 aa  111  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  38.74 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
142 aa  62.4  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  30 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
207 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  50 
 
 
315 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  20 
 
 
150 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  27.96 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  34.62 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 
89 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
119 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  51.11 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
116 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 
109 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0361  hypothetical protein  34.43 
 
 
182 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
132 aa  41.6  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>