More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2600 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
376 aa  744    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  56.68 
 
 
762 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  47.11 
 
 
351 aa  291  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  44.07 
 
 
354 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  44.48 
 
 
371 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  43.29 
 
 
366 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  41.67 
 
 
380 aa  243  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  41.55 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  44.25 
 
 
349 aa  242  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  41.29 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  39.65 
 
 
391 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.79 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.79 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  41.4 
 
 
495 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.23 
 
 
353 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.23 
 
 
357 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  41.93 
 
 
357 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.23 
 
 
357 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
357 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
353 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  40.79 
 
 
348 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.54 
 
 
357 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  42.54 
 
 
357 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  42.54 
 
 
357 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  42.54 
 
 
357 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  42.17 
 
 
321 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  41.12 
 
 
385 aa  225  8e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  40.06 
 
 
326 aa  225  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 
496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  34.38 
 
 
441 aa  222  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  39.69 
 
 
319 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  39.69 
 
 
319 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  42.38 
 
 
354 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 
361 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  41.14 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  41.14 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  40.84 
 
 
357 aa  212  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  36.74 
 
 
406 aa  210  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  39.94 
 
 
386 aa  209  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  40.31 
 
 
349 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
372 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  38.85 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 
348 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  40.51 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  40.06 
 
 
521 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
369 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  39.09 
 
 
349 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  36.13 
 
 
330 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.47 
 
 
387 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  34.79 
 
 
355 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  38.79 
 
 
360 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  40.79 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  39.88 
 
 
491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  40.79 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  36.62 
 
 
360 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  38.36 
 
 
407 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
542 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 
545 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
360 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  34.15 
 
 
425 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.55 
 
 
600 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
369 aa  169  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.33 
 
 
403 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2516  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  38.59 
 
 
370 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  33.61 
 
 
340 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  34.71 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  32.3 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
333 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1209  glycosyl transferase family 4  33.13 
 
 
449 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0891  family 4 glycosyl transferase  36.05 
 
 
402 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2395  family 4 glycosyl transferase  37.61 
 
 
372 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  37.5 
 
 
317 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.63 
 
 
416 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
591 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.42 
 
 
329 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  35.78 
 
 
391 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
380 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  34.19 
 
 
554 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.41 
 
 
551 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1295  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
403 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.025134  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2614  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  31.76 
 
 
399 aa  155  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
399 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  36.14 
 
 
353 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2347  glycosyl transferase family 4  35.29 
 
 
370 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  35.65 
 
 
382 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  33.63 
 
 
375 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
399 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
399 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  34.6 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  29.7 
 
 
394 aa  152  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2416  putative teichoic acid linkage unit synthesis (synthesis of undecaprenylpyrophosphate-N-aetylglucosamine )  33.14 
 
 
387 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1014  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
369 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.258485  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  31.44 
 
 
367 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3910  glycosyl transferase family 4  36.82 
 
 
367 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.993379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6145  glycosyl transferase family 4  33.24 
 
 
389 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.41 
 
 
427 aa  149  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1064  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.87 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>