244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1852 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1852  Hsp33 protein  100 
 
 
296 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000569764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2900  Hsp33 protein  57.79 
 
 
292 aa  364  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000174602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3417  Hsp33 protein  48.61 
 
 
292 aa  295  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0062  Hsp33-like chaperonin  46.58 
 
 
291 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0066  Hsp33-like chaperonin  47.12 
 
 
295 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000194487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1343  Hsp33 protein  44.9 
 
 
294 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000573361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10630  Hsp33 protein  47.57 
 
 
294 aa  285  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000018588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0064  Hsp33-like chaperonin  46.44 
 
 
296 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0950  Hsp33 protein  47.1 
 
 
301 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000811074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0062  Hsp33-like chaperonin  46.55 
 
 
291 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0074  Hsp33-like chaperonin  47.24 
 
 
291 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.638833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0547  Hsp33-like chaperonin  49.12 
 
 
293 aa  279  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0534  Hsp33-like chaperonin  49.12 
 
 
293 aa  279  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0151  Hsp33-like chaperonin  48.45 
 
 
293 aa  277  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1374  Hsp33 protein  43.2 
 
 
293 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000113565  hitchhiker  0.0000000423891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0065  Hsp33-like chaperonin  46.55 
 
 
291 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0066  Hsp33-like chaperonin  46.55 
 
 
291 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0062  Hsp33-like chaperonin  46.55 
 
 
291 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0062  Hsp33-like chaperonin  46.55 
 
 
291 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0066  Hsp33-like chaperonin  46.55 
 
 
291 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.77319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2063  Hsp33-like chaperonin  49.49 
 
 
294 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0078  Hsp33-like chaperonin  46.55 
 
 
291 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0075  Hsp33-like chaperonin  46.55 
 
 
291 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.05774 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5242  Hsp33-like chaperonin  46.55 
 
 
291 aa  275  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0777269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2157  Hsp33-like chaperonin  45.3 
 
 
319 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1868  Hsp33-like chaperonin  45.3 
 
 
316 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24260  disulfide bond chaperone  43.62 
 
 
308 aa  250  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0269  Hsp33-like chaperonin  42.16 
 
 
306 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0204  Hsp33 protein  41.64 
 
 
297 aa  246  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3348  Hsp33-like chaperonin  43.71 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1272  Hsp33-like chaperonin  42.95 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0041  Hsp33-like chaperonin  42.81 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0278  Hsp33-like chaperonin  40.83 
 
 
306 aa  238  6.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.175456  normal  0.0234968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3620  Hsp33-like chaperonin  41.75 
 
 
295 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2209  Hsp33-like chaperonin  42.51 
 
 
288 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3554  Hsp33-like chaperonin  42.23 
 
 
295 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1050  Hsp33 protein  39.59 
 
 
295 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5185  Hsp33-like chaperonin  40.6 
 
 
299 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000472348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0755  Hsp33 protein  43.82 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1023  Hsp33 protein  39.39 
 
 
301 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3840  Hsp33 protein  41.05 
 
 
294 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3227  Hsp33-like chaperonin  39.93 
 
 
301 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2869  Hsp33-like chaperonin  39.93 
 
 
301 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3228  Hsp33 protein  40.69 
 
 
291 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2283  Hsp33-like chaperonin  38.72 
 
 
311 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0258  Hsp33 protein  41.43 
 
 
297 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000999551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4200  Hsp33-like chaperonin  39.46 
 
 
301 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0559  Hsp33-like chaperonin  38.85 
 
 
297 aa  218  8.999999999999998e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.136601  normal  0.555659 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1824  Hsp33-like chaperonin  37.76 
 
 
291 aa  218  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0230  Hsp33-like chaperonin  38.46 
 
 
288 aa  216  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1389  Hsp33 protein  43.19 
 
 
290 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0189  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  37.76 
 
 
299 aa  211  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.8305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1435  Hsp33 protein  43.58 
 
 
290 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0277  redox-related putative chaperone  36.68 
 
 
288 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0405  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  35.84 
 
 
297 aa  202  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0369  Hsp33 protein  36.08 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0218109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2399  Hsp33 protein  37.29 
 
 
344 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1282  Hsp33-like chaperonin  36.79 
 
 
305 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2817  Hsp33 protein  38.01 
 
 
308 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07751  Hsp33-like chaperonin  37.87 
 
 
300 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0022  Hsp33 protein  39.21 
 
 
240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07381  Hsp33-like chaperonin  34.44 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07221  Hsp33-like chaperonin  36.21 
 
 
299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409809 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07201  Hsp33-like chaperonin  35.1 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3383  Hsp33 protein  34.25 
 
 
304 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.133262  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1195  Hsp33-like chaperonin  35.67 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.688399  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0097  Hsp33-like chaperonin  35.88 
 
 
299 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.708069  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07181  Hsp33-like chaperonin  34.78 
 
 
302 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0665  Hsp33-like chaperonin  34.34 
 
 
300 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.294105  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0302  Hsp33 protein  35.07 
 
 
287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15846  predicted protein  36.96 
 
 
291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.718386 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1493  Hsp33 protein  34.97 
 
 
289 aa  159  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.364161  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0553  Hsp33 protein  36.52 
 
 
303 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0157  Hsp33 protein  30.92 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33525  predicted protein  27.82 
 
 
364 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0450  Hsp33 protein  28.72 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0449  Hsp33 protein  28.72 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0421  Hsp33 protein  28.04 
 
 
295 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4148  Hsp33 protein  27.36 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.21226  hitchhiker  0.00565171 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2554  heat shock protein 34  28.32 
 
 
292 aa  115  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  28.96 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  26.9 
 
 
297 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  26.35 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  28.85 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  26.24 
 
 
281 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  26 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  26.24 
 
 
281 aa  93.2  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  28.1 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  27.57 
 
 
289 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  27.71 
 
 
290 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  26.09 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  29.92 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  28.11 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  29.92 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  28.15 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  28.72 
 
 
316 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  29.92 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  29.92 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  29.92 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  28.1 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>