244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0278 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0278  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.175456  normal  0.0234968 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0269  Hsp33-like chaperonin  51.9 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1343  Hsp33 protein  45.17 
 
 
294 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000573361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0066  Hsp33-like chaperonin  44.1 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000194487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0062  Hsp33-like chaperonin  44.14 
 
 
291 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0064  Hsp33-like chaperonin  43.6 
 
 
296 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0062  Hsp33-like chaperonin  43.3 
 
 
291 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1374  Hsp33 protein  46.37 
 
 
293 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000113565  hitchhiker  0.0000000423891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0074  Hsp33-like chaperonin  44.33 
 
 
291 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.638833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0065  Hsp33-like chaperonin  43.99 
 
 
291 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0066  Hsp33-like chaperonin  43.99 
 
 
291 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0062  Hsp33-like chaperonin  43.99 
 
 
291 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0062  Hsp33-like chaperonin  43.99 
 
 
291 aa  257  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0066  Hsp33-like chaperonin  43.99 
 
 
291 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.77319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0075  Hsp33-like chaperonin  43.99 
 
 
291 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.05774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0078  Hsp33-like chaperonin  43.99 
 
 
291 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5242  Hsp33-like chaperonin  43.64 
 
 
291 aa  255  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0777269 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0547  Hsp33-like chaperonin  44.29 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0534  Hsp33-like chaperonin  44.29 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0151  Hsp33-like chaperonin  42.21 
 
 
293 aa  253  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0950  Hsp33 protein  43.45 
 
 
301 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000811074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0041  Hsp33-like chaperonin  43.94 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1852  Hsp33 protein  40.83 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000569764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3417  Hsp33 protein  39.38 
 
 
292 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0405  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  41.24 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0230  Hsp33-like chaperonin  41.26 
 
 
288 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2157  Hsp33-like chaperonin  43 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1868  Hsp33-like chaperonin  43 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2209  Hsp33-like chaperonin  40.42 
 
 
288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3348  Hsp33-like chaperonin  41.87 
 
 
301 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2900  Hsp33 protein  37.93 
 
 
292 aa  232  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000174602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3228  Hsp33 protein  42.31 
 
 
291 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1824  Hsp33-like chaperonin  38.41 
 
 
291 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10630  Hsp33 protein  38.33 
 
 
294 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000018588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3620  Hsp33-like chaperonin  40.48 
 
 
295 aa  225  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3554  Hsp33-like chaperonin  41.18 
 
 
295 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0204  Hsp33 protein  39.72 
 
 
297 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1321  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0189  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  38.33 
 
 
299 aa  215  7e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.8305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2283  Hsp33-like chaperonin  40.96 
 
 
311 aa  215  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24260  disulfide bond chaperone  36.81 
 
 
308 aa  206  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1272  Hsp33-like chaperonin  39.46 
 
 
300 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0258  Hsp33 protein  35.03 
 
 
297 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000999551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3840  Hsp33 protein  37.55 
 
 
294 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3227  Hsp33-like chaperonin  38.36 
 
 
301 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2869  Hsp33-like chaperonin  38.36 
 
 
301 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2063  Hsp33-like chaperonin  36.64 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5185  Hsp33-like chaperonin  37.2 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000472348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1023  Hsp33 protein  37.8 
 
 
301 aa  196  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1389  Hsp33 protein  38.72 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0022  Hsp33 protein  43.1 
 
 
240 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0277  redox-related putative chaperone  38.75 
 
 
288 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1435  Hsp33 protein  38.72 
 
 
290 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1050  Hsp33 protein  34.6 
 
 
295 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2817  Hsp33 protein  36.86 
 
 
308 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0559  Hsp33-like chaperonin  35.96 
 
 
297 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.136601  normal  0.555659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0755  Hsp33 protein  35.84 
 
 
284 aa  185  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4200  Hsp33-like chaperonin  37.8 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0553  Hsp33 protein  40.97 
 
 
303 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2399  Hsp33 protein  34.35 
 
 
344 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3383  Hsp33 protein  34.13 
 
 
304 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.133262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0369  Hsp33 protein  34.27 
 
 
284 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0218109  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1493  Hsp33 protein  34.66 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.364161  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07201  Hsp33-like chaperonin  34.32 
 
 
302 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07181  Hsp33-like chaperonin  35.14 
 
 
302 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1282  Hsp33-like chaperonin  35.43 
 
 
305 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0302  Hsp33 protein  32.37 
 
 
287 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0665  Hsp33-like chaperonin  34.11 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.294105  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15846  predicted protein  33.57 
 
 
291 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.718386 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0097  Hsp33-like chaperonin  33.9 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.708069  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07381  Hsp33-like chaperonin  32.67 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07221  Hsp33-like chaperonin  33.9 
 
 
299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409809 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1195  Hsp33-like chaperonin  32.14 
 
 
305 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.688399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0157  Hsp33 protein  31.37 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07751  Hsp33-like chaperonin  30.92 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056735 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33525  predicted protein  26.38 
 
 
364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0421  Hsp33 protein  26.64 
 
 
295 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0450  Hsp33 protein  25.43 
 
 
295 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0020  chaperonin HSP33  27.08 
 
 
288 aa  106  5e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0449  Hsp33 protein  25.43 
 
 
295 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  27.34 
 
 
286 aa  99.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2554  heat shock protein 34  26.71 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4148  Hsp33 protein  24.57 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.21226  hitchhiker  0.00565171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  28.36 
 
 
289 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  27.56 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  29.41 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  29.41 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  24.83 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  25.17 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  29.35 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  26.32 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1080  Hsp33 protein  21.33 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  25.81 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  23.89 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  23.89 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  25.81 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  25.81 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  26.35 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  28.18 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  25.81 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  25 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>