244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3554 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3554  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3620  Hsp33-like chaperonin  96.94 
 
 		 295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3348  Hsp33-like chaperonin  67.13 
 
 		 301 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0041  Hsp33-like chaperonin  65.64 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0022  Hsp33 protein  64.44 
 
 		 240 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3228  Hsp33 protein  50.87 
 
 		 291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0369  Hsp33 protein  49.3 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0218109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0277  redox-related putative chaperone  48.96 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3383  Hsp33 protein  47.95 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.133262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1343  Hsp33 protein  45.42 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000573361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0064  Hsp33-like chaperonin  44.07 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0066  Hsp33-like chaperonin  42.86 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000194487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0062  Hsp33-like chaperonin  43.3 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1374  Hsp33 protein  44.07 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000113565  hitchhiker  0.0000000423891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0062  Hsp33-like chaperonin  43.75 
 
 		 291 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5242  Hsp33-like chaperonin  42.96 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0777269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0065  Hsp33-like chaperonin  42.61 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0066  Hsp33-like chaperonin  42.61 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0062  Hsp33-like chaperonin  42.61 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0062  Hsp33-like chaperonin  42.61 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0066  Hsp33-like chaperonin  42.61 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.77319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0075  Hsp33-like chaperonin  42.61 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.05774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0078  Hsp33-like chaperonin  42.61 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1868  Hsp33-like chaperonin  42.23 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0074  Hsp33-like chaperonin  42.61 
 
 		 291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.638833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2157  Hsp33-like chaperonin  42.23 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10630  Hsp33 protein  41.96 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000018588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1852  Hsp33 protein  42.23 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000569764  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0534  Hsp33-like chaperonin  39.31 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0547  Hsp33-like chaperonin  39.31 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2900  Hsp33 protein  41.84 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000174602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3417  Hsp33 protein  41.58 
 
 		 292 aa  231  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0151  Hsp33-like chaperonin  38.46 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1050  Hsp33 protein  40.27 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2063  Hsp33-like chaperonin  40.14 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0950  Hsp33 protein  43.36 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000811074  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0278  Hsp33-like chaperonin  41.18 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.175456  normal  0.0234968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0204  Hsp33 protein  40.34 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1321  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0230  Hsp33-like chaperonin  36.81 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2283  Hsp33-like chaperonin  37.92 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0269  Hsp33-like chaperonin  37.5 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1272  Hsp33-like chaperonin  40.33 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5185  Hsp33-like chaperonin  39 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000472348 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0405  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  35.93 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24260  disulfide bond chaperone  36.93 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1824  Hsp33-like chaperonin  35.74 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2209  Hsp33-like chaperonin  35.89 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0097  Hsp33-like chaperonin  39.67 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.708069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3840  Hsp33 protein  36.88 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000889682  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07221  Hsp33-like chaperonin  39.67 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1023  Hsp33 protein  38.26 
 
 		 301 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2869  Hsp33-like chaperonin  38.85 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3227  Hsp33-like chaperonin  38.85 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0189  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  34.72 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.8305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0755  Hsp33 protein  36.14 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4200  Hsp33-like chaperonin  38 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0559  Hsp33-like chaperonin  36.49 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.136601  normal  0.555659 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07181  Hsp33-like chaperonin  36 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07201  Hsp33-like chaperonin  36.63 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0258  Hsp33 protein  34.58 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000999551  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1282  Hsp33-like chaperonin  35.64 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0665  Hsp33-like chaperonin  36 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.294105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2817  Hsp33 protein  38.95 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07381  Hsp33-like chaperonin  34.32 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2399  Hsp33 protein  36.03 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1389  Hsp33 protein  39.36 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1435  Hsp33 protein  39.36 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1195  Hsp33-like chaperonin  34.65 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.688399  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15846  predicted protein  36.4 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.718386 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07751  Hsp33-like chaperonin  32.67 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056735 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1493  Hsp33 protein  32.54 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.364161  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0553  Hsp33 protein  39.1 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0302  Hsp33 protein  31.27 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0157  Hsp33 protein  31.15 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33525  predicted protein  29.24 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0450  Hsp33 protein  31.86 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0449  Hsp33 protein  31.85 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0421  Hsp33 protein  32.09 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  28.48 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2554  heat shock protein 34  26.81 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4148  Hsp33 protein  31.76 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.21226  hitchhiker  0.00565171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  31.21 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  27.27 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  27.27 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  29.17 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  26.94 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  27.33 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  26.58 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  27.4 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  28.57 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  26.94 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  26.82 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  23.97 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  27.7 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  23.29 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  27.03 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  27.62 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  27.62 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  27.62 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  27.62 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>