244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3228 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3228  Hsp33 protein  100 
 
 
291 aa  592  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0041  Hsp33-like chaperonin  55.59 
 
 
301 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3348  Hsp33-like chaperonin  54.55 
 
 
301 aa  322  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3554  Hsp33-like chaperonin  50.87 
 
 
295 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3620  Hsp33-like chaperonin  50.17 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0369  Hsp33 protein  45.64 
 
 
284 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0218109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0022  Hsp33 protein  55.04 
 
 
240 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3383  Hsp33 protein  46.02 
 
 
304 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.133262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0277  redox-related putative chaperone  45.45 
 
 
288 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0066  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
295 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000194487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0062  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0062  Hsp33-like chaperonin  40 
 
 
291 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1343  Hsp33 protein  42.86 
 
 
294 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000573361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0064  Hsp33-like chaperonin  40.48 
 
 
296 aa  235  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1868  Hsp33-like chaperonin  40.82 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2157  Hsp33-like chaperonin  40.82 
 
 
319 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0065  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
291 aa  231  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0066  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
291 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0062  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
291 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0062  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
291 aa  231  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0066  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
291 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.77319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0078  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
291 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0075  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
291 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.05774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0074  Hsp33-like chaperonin  41.18 
 
 
291 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.638833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1852  Hsp33 protein  40.69 
 
 
296 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000569764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5242  Hsp33-like chaperonin  41.18 
 
 
291 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0777269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1374  Hsp33 protein  40 
 
 
293 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000113565  hitchhiker  0.0000000423891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0151  Hsp33-like chaperonin  37.85 
 
 
293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10630  Hsp33 protein  38.25 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000018588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1050  Hsp33 protein  40.48 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0534  Hsp33-like chaperonin  36.81 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0547  Hsp33-like chaperonin  36.81 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0230  Hsp33-like chaperonin  38.6 
 
 
288 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0950  Hsp33 protein  40.97 
 
 
301 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000811074  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0269  Hsp33-like chaperonin  39.73 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146823  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0278  Hsp33-like chaperonin  41.96 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.175456  normal  0.0234968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2063  Hsp33-like chaperonin  38.78 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2900  Hsp33 protein  38.01 
 
 
292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000174602  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2209  Hsp33-like chaperonin  38.46 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2283  Hsp33-like chaperonin  39.46 
 
 
311 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3417  Hsp33 protein  35.76 
 
 
292 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1824  Hsp33-like chaperonin  35.56 
 
 
291 aa  205  9e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5185  Hsp33-like chaperonin  39.46 
 
 
299 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000472348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0204  Hsp33 protein  37.72 
 
 
297 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1272  Hsp33-like chaperonin  40.48 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24260  disulfide bond chaperone  35.34 
 
 
308 aa  189  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0405  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  35.74 
 
 
297 aa  188  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3840  Hsp33 protein  35.87 
 
 
294 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000889682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1023  Hsp33 protein  38.49 
 
 
301 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2817  Hsp33 protein  39.53 
 
 
308 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2869  Hsp33-like chaperonin  37.41 
 
 
301 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3227  Hsp33-like chaperonin  37.41 
 
 
301 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1389  Hsp33 protein  37.31 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1435  Hsp33 protein  37.31 
 
 
290 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4200  Hsp33-like chaperonin  37.8 
 
 
301 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0755  Hsp33 protein  35.44 
 
 
284 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2399  Hsp33 protein  35.81 
 
 
344 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0258  Hsp33 protein  32.77 
 
 
297 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000999551  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15846  predicted protein  35.99 
 
 
291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.718386 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0189  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  31.47 
 
 
299 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.8305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0302  Hsp33 protein  33.33 
 
 
287 aa  159  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07751  Hsp33-like chaperonin  34.98 
 
 
300 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0559  Hsp33-like chaperonin  36.77 
 
 
297 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.136601  normal  0.555659 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0097  Hsp33-like chaperonin  33.78 
 
 
299 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.708069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07221  Hsp33-like chaperonin  33.78 
 
 
299 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409809 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1282  Hsp33-like chaperonin  35.45 
 
 
305 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07181  Hsp33-like chaperonin  32.01 
 
 
302 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1195  Hsp33-like chaperonin  35.14 
 
 
305 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.688399  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07201  Hsp33-like chaperonin  31.68 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07381  Hsp33-like chaperonin  31.89 
 
 
300 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0665  Hsp33-like chaperonin  31.89 
 
 
300 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.294105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0157  Hsp33 protein  31.65 
 
 
311 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0553  Hsp33 protein  35.27 
 
 
303 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0450  Hsp33 protein  33.45 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0449  Hsp33 protein  32.75 
 
 
295 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1493  Hsp33 protein  31.34 
 
 
289 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.364161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0421  Hsp33 protein  33.1 
 
 
295 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4148  Hsp33 protein  33.8 
 
 
294 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.21226  hitchhiker  0.00565171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  30.03 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33525  predicted protein  27.57 
 
 
364 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  27.52 
 
 
297 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2554  heat shock protein 34  25.96 
 
 
292 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl018  putative hsp33 redox-regulated chaperone  25.69 
 
 
287 aa  103  4e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  28.42 
 
 
289 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  28.07 
 
 
292 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  28.57 
 
 
295 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  27.82 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  99.4  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  26.99 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  28.62 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  26.64 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  26.76 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  28.03 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  28.32 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  26.48 
 
 
294 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  26.48 
 
 
294 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  28.92 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  26.48 
 
 
294 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  26.9 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>