More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0262 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0262  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
431 aa  883    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000913374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2013  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.68 
 
 
431 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0170243  normal  0.240578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2594  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.3 
 
 
432 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4304  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.11 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.487734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2048  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.29 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19350  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  54.82 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458015 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2022  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.05 
 
 
434 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0057  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
438 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.944563  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0557  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.28 
 
 
432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588024  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1397  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
435 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2590  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
434 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2416  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.03 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00821851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2275  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.59 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0718764  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.11 
 
 
447 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18451  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 
438 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2209  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
445 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0927  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.31 
 
 
441 aa  431  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3394  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.06 
 
 
443 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321961  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1371  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
443 aa  432  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10601  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
434 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.107286  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1026  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.15 
 
 
435 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.993795  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0026  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
438 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.938682  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
438 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0590  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
436 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.291608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2265  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.75 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06161  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
436 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06551  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.45 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555624  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90997  predicted protein  47.94 
 
 
443 aa  398  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.17 
 
 
436 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05799  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  45.59 
 
 
456 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.22549  hitchhiker  0.00000000000409555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.26 
 
 
418 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.15 
 
 
418 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
418 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.7 
 
 
429 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.2 
 
 
434 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.42 
 
 
420 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_1184  predicted protein  45.75 
 
 
420 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.730647 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 
430 aa  364  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.15 
 
 
415 aa  363  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.15 
 
 
415 aa  363  4e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.82 
 
 
425 aa  361  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 
418 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.09 
 
 
415 aa  358  8e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.74 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06240  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase, putative  43.4 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.76 
 
 
427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.79 
 
 
421 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.79 
 
 
421 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.01 
 
 
419 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.72 
 
 
418 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.31 
 
 
421 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.85 
 
 
415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.14 
 
 
411 aa  353  4e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.32 
 
 
415 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.07 
 
 
415 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.2 
 
 
419 aa  352  8e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  44.8 
 
 
428 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.77 
 
 
423 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.03 
 
 
423 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.04 
 
 
421 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.56 
 
 
418 aa  348  8e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.53 
 
 
410 aa  348  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.36 
 
 
435 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.51 
 
 
421 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.52 
 
 
423 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.01 
 
 
416 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 
419 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.33 
 
 
414 aa  347  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.82 
 
 
418 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.77 
 
 
418 aa  345  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.79 
 
 
426 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.79 
 
 
426 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.16 
 
 
423 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.38 
 
 
419 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0634  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.95 
 
 
407 aa  345  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.82 
 
 
423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.3 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.19 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.52 
 
 
423 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.26 
 
 
426 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_55086  delta l-pyrroline-5-carboxylate synthetase  44.11 
 
 
747 aa  343  5e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.26 
 
 
426 aa  342  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.57 
 
 
432 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
423 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.04 
 
 
417 aa  340  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.54 
 
 
426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.06 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.5 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.82 
 
 
435 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.71 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.99 
 
 
426 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.71 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.71 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.71 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.71 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.82 
 
 
423 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.71 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.71 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.99 
 
 
426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.59 
 
 
422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>