More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4452 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  73.53 
 
 		 511 aa  793    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2681  sulphate transporter  75.94 
 
 		 504 aa  798    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.529175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12953  Sulfate permease family protein  66.86 
 
 		 509 aa  687    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.215491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0671  sulfate transporter  70 
 
 		 510 aa  740    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.045325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  73.87 
 
 		 509 aa  790    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  100 
 
 		 512 aa  1023    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  64.26 
 
 		 512 aa  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0394  sulphate transporter  62.08 
 
 		 512 aa  619  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  56.27 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  54.65 
 
 		 519 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4141  sulfate permease family protein  56.74 
 
 		 509 aa  581  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.284646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  55.15 
 
 		 540 aa  578  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0608  sulphate transporter  56.39 
 
 		 521 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03661  Sulfate permease family protein  55.11 
 
 		 521 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  54.47 
 
 		 521 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  56.18 
 
 		 520 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  54.07 
 
 		 519 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000377165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  55.04 
 
 		 519 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  53.88 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000674443  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  53.88 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000311132  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1592  sulphate transporter  52.71 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.795484  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1706  sulphate transporter  53.68 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000026912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  54.44 
 
 		 521 aa  558  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  53.94 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2568  sulphate transporter  53.68 
 
 		 519 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.612653  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2406  sulphate transporter  53.1 
 
 		 525 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2031  sulphate transporter  54.47 
 
 		 518 aa  545  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.62655  normal  0.79554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2635  sulphate transporter  54.07 
 
 		 518 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000740978  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2476  sulphate transporter  53.29 
 
 		 525 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02920  hypothetical protein  51.94 
 
 		 519 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2232  putative sulfate transporter  52.13 
 
 		 515 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1261  sulphate transporter  52.73 
 
 		 515 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3208  sulphate transporter  52.59 
 
 		 540 aa  525  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002987  sulfate permease  52.3 
 
 		 504 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2067  sulfate transporter  52.73 
 
 		 534 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2321  sulphate transporter  53.23 
 
 		 536 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  49.71 
 
 		 541 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  49.31 
 
 		 509 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  50.95 
 
 		 495 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1689  sulphate transporter  47.36 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0911  sulphate transporter  46.79 
 
 		 539 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.791463  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0223  sulphate transporter  46.79 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.836452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  50.42 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3386  sulphate transporter  49.79 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3593  sulfate permease family protein  50 
 
 		 481 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3557  sulphate transporter  51.04 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1752  sulphate transporter  49.58 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.516323  normal  0.0556997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3685  sulphate transporter  51.04 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0439224  normal  0.0112411 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1533  sulphate transporter  45.21 
 
 		 525 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41950  sulphate transporter  51.15 
 
 		 481 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32829  SulP family transporter: sulfate; sulfate transporter of the Major Facilitator Superfamily (MFS)  49.39 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  41.09 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  41.79 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  41.09 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  41.3 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  40.67 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  41.3 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  40.88 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  41.09 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  40.46 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  41.09 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  37.7 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  38.4 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  41.09 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  40.04 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  39.55 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  39.69 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  38.93 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  39.25 
 
 		 484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  39.34 
 
 		 496 aa  360  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  39.34 
 
 		 496 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  39.45 
 
 		 492 aa  359  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  39.45 
 
 		 492 aa  359  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  38.16 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  39.34 
 
 		 496 aa  354  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  38.65 
 
 		 502 aa  352  7e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  38.7 
 
 		 494 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  39.32 
 
 		 483 aa  349  7e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1646  sulphate transporter  38.92 
 
 		 527 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0415983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2784  sulphate transporter  38.52 
 
 		 494 aa  345  8.999999999999999e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.423283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1631  sulphate transporter  39.57 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  37.81 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4351  sulphate transporter  39.54 
 
 		 496 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  38.12 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0913  sulphate transporter  39.62 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.846691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0902  sulphate transporter  39.62 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0896  sulphate transporter  39.62 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  37.6 
 
 		 502 aa  340  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  37.82 
 
 		 499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  37.71 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  37.86 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3144  sulphate transporter  40.12 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0374  sulphate transporter  38.09 
 
 		 498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  37.39 
 
 		 499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  37.01 
 
 		 495 aa  336  5.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  37.15 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  39.07 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0431  sulphate transporter  37.9 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4611  sulphate transporter  38.52 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  37.08 
 
 		 496 aa  333  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>