More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1055 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  100 
 
 		 51 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  82.98 
 
 		 52 aa  80.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  77.55 
 
 		 55 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  76.6 
 
 		 50 aa  74.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  72.55 
 
 		 52 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  76.6 
 
 		 52 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  78.72 
 
 		 52 aa  72.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  70.59 
 
 		 52 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  70.21 
 
 		 51 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  74.47 
 
 		 53 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  70.83 
 
 		 48 aa  69.7  0.00000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  71.74 
 
 		 53 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  74.47 
 
 		 52 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 53 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  70.83 
 
 		 48 aa  67.4  0.00000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 53 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 53 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  67.39 
 
 		 53 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  71.74 
 
 		 53 aa  63.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 47 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 47 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  68.89 
 
 		 46 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  71.43 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  68.89 
 
 		 46 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3218  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2847  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 46 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  73.81 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4243  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 47 aa  58.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0239803  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 46 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0553  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 47 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  61.22 
 
 		 51 aa  57.4  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0828  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 47 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6078  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 47 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0153372  normal  0.186265 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 45 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3614  50S ribosomal protein L34P  68.18 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 45 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4700  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 45 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 54 aa  57  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>