16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0008 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  702    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4796  hypothetical protein  30.25 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1549  hypothetical protein  29.43 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0676157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0496  hypothetical protein  28.36 
 
 		 335 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1168  hypothetical protein  30.49 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1648  hypothetical protein  30.49 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0284  hypothetical protein  29.57 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1623  hypothetical protein  30.4 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1568  hypothetical protein  30.25 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1590  hypothetical protein  29.88 
 
 		 373 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790201  normal  0.0437711 
 
 
-
 
NC_003296  RS03700  hypothetical protein  27.9 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2738  hypothetical protein  32.72 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765019  normal  0.0159593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1828  hypothetical protein  27.18 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23040  uncharacterized conserved protein (DUF2186)  25.3 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265776  normal  0.0531074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10855  hypothetical protein  23.4 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.23283e-23  hitchhiker  0.00000000756843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04220  hypothetical protein  24.09 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>