227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1039 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1039  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  634    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  33.46 
 
 
283 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  35.61 
 
 
290 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  34.74 
 
 
286 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  32.73 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  29.09 
 
 
287 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2185  hypothetical protein  30.11 
 
 
286 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  31.16 
 
 
285 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  31.27 
 
 
299 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  31.16 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  32.62 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2703  hypothetical protein  29.47 
 
 
301 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  29.21 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  34.57 
 
 
295 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  28.99 
 
 
281 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  28 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  31.46 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  31.46 
 
 
285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  30.55 
 
 
311 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  28.68 
 
 
283 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  33.08 
 
 
278 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0748  hypothetical protein  28 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0644757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  28.89 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  28.01 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  28.36 
 
 
289 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  30.58 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1994  hypothetical protein  28.78 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000553659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  27.86 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  29.59 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  27.08 
 
 
293 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  27.08 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2862  protein of unknown function DUF161  30.77 
 
 
287 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  31.09 
 
 
286 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  26.35 
 
 
293 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  31.84 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0780  hypothetical protein  28.37 
 
 
293 aa  109  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0139128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  26.35 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  26.35 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  26.35 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  26.35 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  26.35 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  26.35 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  27.15 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  26.06 
 
 
290 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0907  hypothetical protein  27.02 
 
 
296 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00009581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  26.67 
 
 
278 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  26.71 
 
 
293 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1419  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  28.62 
 
 
296 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0748  hypothetical protein  26.62 
 
 
295 aa  106  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.796789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  26.71 
 
 
278 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  26.71 
 
 
278 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  26.59 
 
 
279 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  27.11 
 
 
298 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  26.45 
 
 
278 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  26.71 
 
 
288 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  29.88 
 
 
283 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  25.99 
 
 
278 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1067  hypothetical protein  28.68 
 
 
333 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1062  hypothetical protein  28.68 
 
 
333 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  24.63 
 
 
285 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  25.63 
 
 
278 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  25.63 
 
 
278 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  25.63 
 
 
278 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  25.63 
 
 
278 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  25.63 
 
 
278 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1171  hypothetical protein  28.68 
 
 
285 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1245  hypothetical protein  28.31 
 
 
285 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1072  hypothetical protein  28.68 
 
 
293 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  25.63 
 
 
278 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1085  hypothetical protein  28.68 
 
 
333 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1282  hypothetical protein  27.94 
 
 
285 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  27.34 
 
 
290 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1322  hypothetical protein  27.94 
 
 
285 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  26.1 
 
 
285 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2920  protein of unknown function DUF161  27.34 
 
 
303 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000232125  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  26.94 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  26.69 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  26.86 
 
 
297 aa  99  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  26.86 
 
 
297 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2546  hypothetical protein  27.61 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2836  protein of unknown function DUF161  30.58 
 
 
281 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1288  protein of unknown function DUF161  28.41 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  26.98 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  26.86 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  26.5 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  27.68 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  26.14 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  26.15 
 
 
297 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1217  hypothetical protein  29.04 
 
 
285 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4124  hypothetical protein  29.04 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0885  protein of unknown function DUF161  27.24 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000434482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  26.15 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  26.15 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  26.15 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  26.15 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  26.15 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3566  protein of unknown function DUF161  27.74 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332576  normal  0.685125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2616  protein of unknown function DUF161  28.47 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000720176  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1475  protein of unknown function DUF161  25.29 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>