41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0016 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_R0016  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000723443  decreased coverage  0.0000959662 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0024  tRNA-Tyr  97.59 
 
 		 83 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0015  tRNA-Tyr  96.39 
 
 		 83 bp  141  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839238  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0011  tRNA-Tyr  95.18 
 
 		 83 bp  133  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000214053  hitchhiker  0.00323075 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t09  tRNA-Tyr  95.18 
 
 		 85 bp  125  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000014277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0055  tRNA-Tyr  95.18 
 
 		 82 bp  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000670702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0004  tRNA-Tyr  97.06 
 
 		 83 bp  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0005  tRNA-Tyr  88.71 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.309794  hitchhiker  0.000058152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  90.2 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0019  tRNA-Tyr  90.2 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0011  tRNA-Tyr  88.71 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0587696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0008  tRNA-Tyr  88.71 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0166209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0016  tRNA-Tyr  88.71 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000373252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0024  tRNA-Tyr  88.71 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0067  tRNA-Tyr  88.71 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00323795 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  87.1 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0051  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0013  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000444451  normal  0.406861 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0014  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.673141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0019  tRNA-Tyr  90.91 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00432304  decreased coverage  0.00738157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0308  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.0000522223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0004  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000291052  hitchhiker  0.00000658966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0018  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0060  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0044  tRNA-Tyr  89.8 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0010  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.29414e-23  normal  0.0775658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0014  tRNA-Tyr  89.8 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.64782e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tTyr01  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0010  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000473639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0037  tRNA-Tyr  87.23 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000333812  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0050  tRNA-Tyr  86.27 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0039  tRNA-Tyr  86.27 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0016  tRNA-Tyr  86.27 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0035  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.641797  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0405  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00881766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>