206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_R0014 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_R0013  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000444451  normal  0.406861 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0014  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.673141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0051  tRNA-Tyr  97.62 
 
 		 84 bp  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  94.64 
 
 		 84 bp  87.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0010  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0008  tRNA-Tyr  94.23 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323474  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0086  tRNA-Tyr  92.59 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000985673  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0017  tRNA-Tyr  92.59 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0316061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0010  tRNA-Tyr  92.59 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0014  tRNA-Tyr  92.59 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000673515  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0012  tRNA-Tyr  91.07 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000365391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t05  tRNA-Tyr  93.62 
 
 		 81 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000929423  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  95.24 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0011  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0062  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.101175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3169t  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000963537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3168t  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3167t  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000658084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0090  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000426682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00075  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000048411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0016  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000723443  decreased coverage  0.0000959662 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0093  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000017829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0064  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4352  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000588121  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4718  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.22023e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0052  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.573549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5101  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000185347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4549  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000359327  hitchhiker  0.00000000000121072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0065  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695286  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0357  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189784  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4474  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000330783  hitchhiker  0.00000000000000918445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5442  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000118281  hitchhiker  0.000431346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0006  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000152746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0012  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000806893  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0015  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839238  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4384  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000011593  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4471  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000736073  hitchhiker  0.00060065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4663  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.25071e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4425  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181979  hitchhiker  0.0000468307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0043  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0054  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0006  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0044  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0083  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000525158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0004  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000458141  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0108  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000394419  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14005  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.844659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0819  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00026  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0050  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00114696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  90 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t006  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t046  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t047  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0078  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.354946  normal  0.251639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5031  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0188651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0005  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.434844  hitchhiker  0.00676871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R89  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4288  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0151  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000678827  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0077  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359872  normal  0.250777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0005  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0074  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.700319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0075  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0076  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0013  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000242624  normal  0.0244003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0095  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000654361  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0096  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00070521  normal  0.980641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0097  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186117  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0013  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000911406  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0093  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00406786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0094  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000412805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0095  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000439573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0010  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0067  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.439921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0068  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0069  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0013  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000166479  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0092  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0093  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000411147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0094  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4232  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0011  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000044302  hitchhiker  0.000585411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0070  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157981  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0071  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0977282  normal  0.857098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0047  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0048  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0054  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.329016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0055  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0126  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000986876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0076  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.522662  normal  0.249833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0113  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.532695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5032  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0012  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000467845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0056  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0057  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0058  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.17611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4231  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>