More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2087 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  91.32 
 
 
265 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  90.19 
 
 
265 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  88.26 
 
 
265 aa  483  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  89.02 
 
 
265 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  87.17 
 
 
265 aa  477  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  86.42 
 
 
265 aa  474  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.2 
 
 
295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  59.22 
 
 
258 aa  329  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 
267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  57.65 
 
 
262 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.43 
 
 
262 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.45 
 
 
255 aa  313  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.82 
 
 
300 aa  313  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.36 
 
 
253 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  58.96 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  58.96 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  58.96 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.59 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  58.96 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  58.96 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  58.96 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  58.96 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  58.96 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  56.92 
 
 
258 aa  311  5.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.2 
 
 
273 aa  311  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  58.57 
 
 
253 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.57 
 
 
253 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.68 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.37 
 
 
253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.97 
 
 
253 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.69 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.5 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.48 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  57.37 
 
 
253 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  56.75 
 
 
258 aa  301  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.14 
 
 
255 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 
257 aa  299  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  57.09 
 
 
254 aa  298  5e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  54.94 
 
 
260 aa  298  9e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  52.96 
 
 
255 aa  296  2e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  52.99 
 
 
254 aa  296  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  54.72 
 
 
257 aa  295  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  53.36 
 
 
256 aa  295  6e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.29 
 
 
255 aa  295  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.72 
 
 
257 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  52.73 
 
 
257 aa  292  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  57.32 
 
 
249 aa  291  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  54.9 
 
 
256 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  51.95 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  52.94 
 
 
275 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.94 
 
 
259 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.94 
 
 
259 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.12 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  54.58 
 
 
262 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.38 
 
 
284 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 
262 aa  281  9e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  54.18 
 
 
253 aa  281  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.15 
 
 
262 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.78 
 
 
257 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.15 
 
 
254 aa  279  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  51.97 
 
 
257 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  51.97 
 
 
257 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.75 
 
 
253 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  53.36 
 
 
259 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.18 
 
 
257 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.74 
 
 
270 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.13 
 
 
262 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.15 
 
 
257 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.1 
 
 
262 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.78 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.78 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.78 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.78 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.38 
 
 
262 aa  271  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 
266 aa  271  7e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.76 
 
 
263 aa  270  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
262 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  51.79 
 
 
253 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.76 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.96 
 
 
278 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  51.38 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  49.61 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  51.76 
 
 
261 aa  269  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.77 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.59 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  51.79 
 
 
294 aa  268  7e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  50.99 
 
 
262 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  50.99 
 
 
262 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.99 
 
 
262 aa  268  7e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  50.99 
 
 
262 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  50.59 
 
 
253 aa  268  8.999999999999999e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  51.97 
 
 
266 aa  267  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.57 
 
 
264 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.36 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  51.78 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.63 
 
 
274 aa  265  4e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  50.59 
 
 
262 aa  265  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.59 
 
 
262 aa  265  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>