15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1876 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1876  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1695  hypothetical protein  66.67 
 
 
246 aa  358  4e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1084  hypothetical protein  64.49 
 
 
245 aa  340  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1491  hypothetical protein  62.11 
 
 
246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1586  hypothetical protein  55.33 
 
 
246 aa  298  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0196619  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0850  hypothetical protein  57.92 
 
 
246 aa  294  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00832469  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1428  hypothetical protein  46.56 
 
 
264 aa  257  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2097  hypothetical protein  31.09 
 
 
321 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1734  hypothetical protein  27.59 
 
 
273 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825048  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1581  hypothetical protein  26.55 
 
 
274 aa  95.9  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.518967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1899  hypothetical protein  28.12 
 
 
294 aa  91.7  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201368  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0434  hypothetical protein  27.47 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0059  hypothetical protein  27.19 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1650  hypothetical protein  25.87 
 
 
277 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134498  normal  0.369748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2380  hypothetical protein  22.48 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980429  normal  0.518017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>