More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1122 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  100 
 
 
427 aa  877    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  67.15 
 
 
421 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  66.83 
 
 
427 aa  559  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1079  ATPase  64.27 
 
 
421 aa  545  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  61.47 
 
 
421 aa  524  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  60.19 
 
 
419 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  59.22 
 
 
417 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.05 
 
 
418 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  35.68 
 
 
409 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35.31 
 
 
455 aa  236  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  36.71 
 
 
418 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  35.14 
 
 
424 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  33.33 
 
 
405 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  34.32 
 
 
412 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  31.68 
 
 
416 aa  203  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  34.86 
 
 
490 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  35.64 
 
 
419 aa  196  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  33.33 
 
 
414 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  32.38 
 
 
393 aa  194  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  38.31 
 
 
293 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.7 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  40.94 
 
 
267 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  29.92 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
274 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  37.01 
 
 
267 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  38.4 
 
 
286 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  38.59 
 
 
258 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.84 
 
 
273 aa  178  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  34.8 
 
 
273 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  38.04 
 
 
267 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.63 
 
 
255 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  34.94 
 
 
271 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
273 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
273 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
273 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
273 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.49 
 
 
268 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
273 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
273 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.4 
 
 
273 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  30.6 
 
 
536 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.4 
 
 
273 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  36.74 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  36.23 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  36.89 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  37.4 
 
 
269 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.95 
 
 
266 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.72 
 
 
266 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
260 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
257 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  37.15 
 
 
274 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.2 
 
 
271 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.92 
 
 
258 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  38 
 
 
277 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
268 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  37.1 
 
 
271 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
271 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  37.1 
 
 
271 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 
271 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 
271 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 
271 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 
271 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 
271 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  36.48 
 
 
266 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4777  ABC transporter related  38.67 
 
 
265 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0195446  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  38.27 
 
 
255 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
262 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.67 
 
 
302 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  37.04 
 
 
303 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.73 
 
 
266 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  36.11 
 
 
260 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  35.63 
 
 
268 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  36.07 
 
 
270 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
256 aa  169  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
270 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
270 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
270 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  34.4 
 
 
263 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 
270 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
270 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
270 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 
270 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
270 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.33 
 
 
259 aa  168  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  36.48 
 
 
270 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  35.34 
 
 
254 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 
271 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  38.8 
 
 
287 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
270 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  36.06 
 
 
292 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  33.61 
 
 
275 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.4 
 
 
264 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  37.3 
 
 
256 aa  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  35.48 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.4 
 
 
263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  36.11 
 
 
278 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1628  ABC transporter related  38.33 
 
 
268 aa  166  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0337589  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  37.2 
 
 
255 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>