28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0011 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0011  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1352  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1365  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1383  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2543  hypothetical protein  92.05 
 
 
176 aa  343  8e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1073  hypothetical protein  92.05 
 
 
176 aa  343  8e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.195645  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4751  hypothetical protein  44.14 
 
 
174 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4483  hypothetical protein  42.11 
 
 
182 aa  104  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675401  hitchhiker  0.000216351 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0146  hypothetical protein  37.8 
 
 
167 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2730  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.881494  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3862  hypothetical protein  44.33 
 
 
127 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155053  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1917  hypothetical protein  28.29 
 
 
243 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1587  hypothetical protein  44.68 
 
 
80 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.280282  hitchhiker  0.00274669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  32.89 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  32.89 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  32.89 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  32.89 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  32.89 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  32.89 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  32.53 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  32.53 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  34.29 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  34.29 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  34.29 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.57 
 
 
431 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6263  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.57 
 
 
431 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268636  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6012  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.67 
 
 
432 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  23.57 
 
 
431 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>