35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0803 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0803  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.26 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.96 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  33.96 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.96 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.94 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1948  hypothetical protein  36.14 
 
 		 93 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.017196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.94 
 
 		 524 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3712  hypothetical protein  31.03 
 
 		 113 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750791  hitchhiker  0.0000649397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.63 
 
 		 150 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.67 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.77 
 
 		 148 aa  48.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.5 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1010  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.55 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4760  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.23 
 
 		 145 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.92 
 
 		 266 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.93 
 
 		 397 aa  45.1  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.64 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0221  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.76 
 
 		 484 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.057348  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  32.5 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.75 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1408  hypothetical protein  30.95 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  30.34 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4163  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.28 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.67 
 
 		 126 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.95 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  27.43 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1015  proteinase inhibitor I1 Kazal  29.27 
 
 		 343 aa  41.6  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2838  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29 
 
 		 127 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4472  hypothetical protein  30.95 
 
 		 126 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0695471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3896  hypothetical protein  30.95 
 
 		 126 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.612405  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5831  hypothetical protein  30.95 
 
 		 126 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0377295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>