22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1907 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1907  paREP7  100 
 
 
303 aa  598  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000000796589  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  80.32 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0185  paREP7  45.92 
 
 
253 aa  210  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  0.966821 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0327  paREP7  46.34 
 
 
253 aa  206  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0492  hypothetical protein  48.07 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  36.01 
 
 
317 aa  172  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  32.93 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  40.48 
 
 
336 aa  105  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  26.95 
 
 
386 aa  75.5  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  26.95 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1375  hypothetical protein  30.68 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  40.54 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  24 
 
 
241 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1276  hypothetical protein  58.14 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.160585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2036  hypothetical protein  58.14 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  33.56 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1695  paREP7  58.14 
 
 
226 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1150  hypothetical protein  35.16 
 
 
254 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  0.0462883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4653  hypothetical protein  23.28 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  30.77 
 
 
241 aa  43.5  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1156  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  32.29 
 
 
212 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>