18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1388 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.36 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.9 
 
 		 170 aa  89  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.95 
 
 		 170 aa  87.8  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  30.06 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.05 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  23.61 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.55 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.63 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.24 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  23.18 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  27.98 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  21.05 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  30.34 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  21.05 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  21.05 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  22.99 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  26.89 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>