35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1497 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  354  2.9999999999999997e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  50.88 
 
 		 255 aa  155  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  51.88 
 
 		 353 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  47.67 
 
 		 189 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  52.52 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  57.38 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  45.33 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  48.2 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  48.91 
 
 		 145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  40.99 
 
 		 267 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  42.14 
 
 		 135 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  46.79 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  35.67 
 
 		 265 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  31.21 
 
 		 288 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  34.46 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  45.95 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  32.52 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  32.33 
 
 		 232 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  33.65 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  38.6 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  30.95 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  38.24 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  31.03 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  34.04 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  34.34 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  38.57 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  34.25 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2170  hypothetical protein  46.67 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  23.78 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  26.81 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  28.87 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  29.27 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  23 
 
 		 329 aa  40.8  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>