299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1259 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  53.29 
 
 
708 aa  704  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  100 
 
 
713 aa  1463  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1195  polyphosphate kinase  48.65 
 
 
728 aa  653  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  75.43 
 
 
708 aa  1066  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  69.9 
 
 
713 aa  1028  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  1.77929e-06  hitchhiker  3.12849e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  50 
 
 
736 aa  678  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  68.74 
 
 
709 aa  1019  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  52.86 
 
 
708 aa  726  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  52.25 
 
 
700 aa  681  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  74.09 
 
 
707 aa  1066  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  68.6 
 
 
707 aa  1004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  48.2 
 
 
720 aa  674  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  48.95 
 
 
731 aa  684  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  52.51 
 
 
695 aa  700  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  48.42 
 
 
720 aa  677  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  51.26 
 
 
715 aa  679  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  51.33 
 
 
722 aa  714  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  49.64 
 
 
702 aa  646  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  52.17 
 
 
701 aa  692  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  51.33 
 
 
722 aa  714  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  50.07 
 
 
721 aa  666  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  55.78 
 
 
700 aa  731  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  51.31 
 
 
743 aa  701  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  49.37 
 
 
714 aa  672  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  47.39 
 
 
731 aa  655  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  66.72 
 
 
696 aa  960  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  77.34 
 
 
709 aa  1119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  48.26 
 
 
717 aa  640  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  50.44 
 
 
721 aa  668  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  49.25 
 
 
743 aa  665  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  46.93 
 
 
691 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  47.6 
 
 
882 aa  630  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  47.98 
 
 
741 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  46.47 
 
 
729 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  46.78 
 
 
728 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  47.34 
 
 
763 aa  625  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  47.97 
 
 
702 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  46.32 
 
 
737 aa  616  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  47.68 
 
 
702 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  47.68 
 
 
702 aa  613  1e-174  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  47.68 
 
 
702 aa  613  1e-174  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  47.68 
 
 
702 aa  613  1e-174  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  47.68 
 
 
702 aa  613  1e-174  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  47.83 
 
 
700 aa  613  1e-174  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  47.68 
 
 
702 aa  613  1e-174  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  47.83 
 
 
702 aa  613  1e-174  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  46.63 
 
 
742 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  47.38 
 
 
702 aa  610  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  46.63 
 
 
742 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  46.63 
 
 
742 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  45.4 
 
 
721 aa  608  1e-172  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  44.54 
 
 
744 aa  606  1e-172  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  47.27 
 
 
712 aa  604  1e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  46.64 
 
 
727 aa  603  1e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  46.77 
 
 
730 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  45.19 
 
 
712 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  44.91 
 
 
762 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  44.11 
 
 
705 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  46.36 
 
 
745 aa  598  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  46.92 
 
 
750 aa  601  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  44.23 
 
 
766 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  47.82 
 
 
705 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  44.27 
 
 
765 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  45.82 
 
 
760 aa  593  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  46.04 
 
 
712 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  47.03 
 
 
712 aa  593  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  44.26 
 
 
736 aa  594  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  44.91 
 
 
696 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  45.31 
 
 
769 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  8.56651e-08 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  46.6 
 
 
713 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  45.99 
 
 
693 aa  591  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  47.77 
 
 
729 aa  591  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  45.22 
 
 
692 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  44.51 
 
 
743 aa  586  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  45.48 
 
 
749 aa  587  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  45.27 
 
 
694 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  44.31 
 
 
681 aa  588  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  45.61 
 
 
753 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  44.75 
 
 
692 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  45.67 
 
 
702 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1116  polyphosphate kinase  46.66 
 
 
738 aa  582  1e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0590  polyphosphate kinase  44.67 
 
 
733 aa  582  1e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0330853  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  46.61 
 
 
726 aa  583  1e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  44.69 
 
 
734 aa  583  1e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  43.67 
 
 
731 aa  584  1e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  44.87 
 
 
749 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  45.87 
 
 
788 aa  581  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  45.87 
 
 
788 aa  581  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  44.87 
 
 
750 aa  575  1e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  44.7 
 
 
734 aa  577  1e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  43.84 
 
 
745 aa  576  1e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.85763e-08 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  45.39 
 
 
710 aa  577  1e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  44.08 
 
 
746 aa  576  1e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  45.39 
 
 
687 aa  576  1e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  44.33 
 
 
736 aa  577  1e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  44.22 
 
 
746 aa  577  1e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  44.08 
 
 
764 aa  573  1e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  43.88 
 
 
697 aa  574  1e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  43.88 
 
 
709 aa  573  1e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  44.52 
 
 
726 aa  572  1e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>