17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0046 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0046  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  316  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0064  hypothetical protein  82.28 
 
 
162 aa  271  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0663  hypothetical protein  57.59 
 
 
157 aa  197  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0823  hypothetical protein  55.7 
 
 
161 aa  185  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.324889  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0441  hypothetical protein  47.44 
 
 
176 aa  142  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.346927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1211  hypothetical protein  44.44 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0202037  normal  0.640858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0995  hypothetical protein  42.17 
 
 
182 aa  130  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.606153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0989  hypothetical protein  37.34 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00450031  hitchhiker  0.000444366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1290  hypothetical protein  39.62 
 
 
184 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2216  hypothetical protein  31.71 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1024  hypothetical protein  30.14 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0441  hypothetical protein  29.07 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3676  hypothetical protein  30.2 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0958587 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1267  hypothetical protein  23.75 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.793977  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0534  hypothetical protein  28.12 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2873  hypothetical protein  26.04 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1714  hypothetical protein  25.16 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>