More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1471 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  100 
 
 		 240 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0217  TerC family integral membrane protein  88.7 
 
 		 239 aa  377  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0179  TerC family integral membrane protein  87.87 
 
 		 239 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0196  TerC family integral membrane protein  86.25 
 
 		 242 aa  371  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  63.75 
 
 		 246 aa  297  9e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  62.08 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  61.09 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  57.2 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  57.5 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  57.08 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  59.49 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  53.36 
 
 		 248 aa  261  8e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  54.55 
 
 		 249 aa  258  6e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  57.87 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  53.75 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  55.51 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  52.54 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  52.79 
 
 		 251 aa  245  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  52.79 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  53.36 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  50.42 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  51.46 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  53.45 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  51.23 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  54.15 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  49.13 
 
 		 528 aa  234  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  56.28 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  47.23 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  50.87 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  54.59 
 
 		 256 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  55.46 
 
 		 253 aa  232  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  53.28 
 
 		 254 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  53.71 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  49.13 
 
 		 577 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  56.58 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  55.93 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  55.93 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  55.93 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  55.93 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  55.93 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  55.93 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  55.93 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  55.93 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  55.93 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  53.28 
 
 		 265 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  47.48 
 
 		 518 aa  230  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  54.43 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  56.14 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  54.66 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  54.66 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  46.81 
 
 		 522 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  54.66 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  51.71 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  54.66 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  54.66 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  46.22 
 
 		 522 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  55.79 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  55.93 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  48.07 
 
 		 514 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  47.72 
 
 		 518 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  51.67 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  46.78 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  46.78 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  53.51 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.78 
 
 		 516 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.78 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.78 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  48.44 
 
 		 519 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.44 
 
 		 519 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.78 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.78 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  51.68 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  46.78 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  51.68 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.44 
 
 		 519 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.44 
 
 		 519 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  46.78 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  48.44 
 
 		 519 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  44.73 
 
 		 523 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1788  hypothetical protein  56.41 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.377991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  52.1 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  44.73 
 
 		 523 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  44.73 
 
 		 523 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  49.58 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  49.78 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  47.19 
 
 		 529 aa  225  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  45.38 
 
 		 522 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  48.33 
 
 		 259 aa  224  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  46.61 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  44.3 
 
 		 523 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  46.75 
 
 		 529 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  47.66 
 
 		 522 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  54.7 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  46.58 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  46.84 
 
 		 518 aa  222  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  50.22 
 
 		 528 aa  222  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  50.88 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  46.41 
 
 		 515 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>