More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0536 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  80.48 
 
 
460 aa  775    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  80.26 
 
 
460 aa  776    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  67.39 
 
 
461 aa  634    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  79.83 
 
 
460 aa  767    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
461 aa  932    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  65.65 
 
 
462 aa  621  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  64.07 
 
 
463 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  64.58 
 
 
460 aa  586  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  54.97 
 
 
477 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  49.09 
 
 
494 aa  474  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  38.1 
 
 
440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  37.04 
 
 
436 aa  298  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  36.52 
 
 
437 aa  297  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  37.58 
 
 
436 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  36.7 
 
 
440 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  37.42 
 
 
442 aa  293  4e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  37.36 
 
 
436 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 
436 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  36.11 
 
 
439 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  36.18 
 
 
438 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  36.18 
 
 
438 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  35.06 
 
 
441 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  36.13 
 
 
493 aa  289  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  36.63 
 
 
494 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  36.12 
 
 
439 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  38.39 
 
 
439 aa  287  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.32 
 
 
438 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  37.5 
 
 
441 aa  286  5e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  37.15 
 
 
441 aa  286  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  35.06 
 
 
448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  34.39 
 
 
449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  34.13 
 
 
439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  34.64 
 
 
436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  37.74 
 
 
438 aa  281  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  36.5 
 
 
444 aa  279  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  34.39 
 
 
449 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  34.95 
 
 
436 aa  278  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  37.64 
 
 
440 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  36.07 
 
 
442 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  36.11 
 
 
441 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  36.46 
 
 
440 aa  276  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  34.34 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  35.6 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  35.6 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  35.6 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  35.6 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  35.6 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  35.6 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  35.6 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  35.96 
 
 
441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  35.6 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  37.22 
 
 
435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  36.8 
 
 
434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  36.16 
 
 
427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  34.95 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  34.12 
 
 
440 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  33.9 
 
 
440 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  34.2 
 
 
441 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  35.17 
 
 
455 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  36.08 
 
 
438 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  36.24 
 
 
436 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  36.24 
 
 
436 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  34.86 
 
 
439 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  34.9 
 
 
443 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  34.51 
 
 
436 aa  270  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  33.7 
 
 
436 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  35.9 
 
 
435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  34.29 
 
 
436 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  34.29 
 
 
436 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  34.06 
 
 
465 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  32.83 
 
 
438 aa  259  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  32.97 
 
 
446 aa  259  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  34.27 
 
 
443 aa  259  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  32.68 
 
 
444 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  33.98 
 
 
465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  33.19 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0426  GTP-binding protein EngA  34.76 
 
 
442 aa  254  3e-66  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000271389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  33.77 
 
 
465 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  32.97 
 
 
498 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  35.16 
 
 
438 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  35.28 
 
 
434 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  33.77 
 
 
490 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  32.53 
 
 
498 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  32.97 
 
 
452 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  33.92 
 
 
463 aa  246  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  34.34 
 
 
447 aa  246  9e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  33.76 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  33.48 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1169  GTP-binding protein EngA  33.99 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.306254 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  36.09 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  34.14 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  32.41 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  33.99 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  32.9 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  33.48 
 
 
495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  32.9 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  34.28 
 
 
441 aa  244  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  32.1 
 
 
458 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  34.76 
 
 
453 aa  243  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>