21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0100 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0100  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  504  1e-142  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  6.44267e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0669  hypothetical protein  56.12 
 
 
242 aa  263  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0635  hypothetical protein  55.16 
 
 
242 aa  256  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0742  hypothetical protein  55.56 
 
 
129 aa  129  4e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.228356  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  33.82 
 
 
407 aa  67.8  1e-10  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  26.8 
 
 
419 aa  59.3  5e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  26.76 
 
 
420 aa  57.4  2e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  22.78 
 
 
421 aa  57  3e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  24.68 
 
 
383 aa  57  3e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  26.39 
 
 
478 aa  56.6  4e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.1163e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  25.47 
 
 
421 aa  56.2  5e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  25.47 
 
 
421 aa  56.2  5e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  22.78 
 
 
440 aa  55.1  9e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  25.47 
 
 
421 aa  54.3  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  24.82 
 
 
430 aa  53.1  4e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  24.82 
 
 
420 aa  52.4  6e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  25.9 
 
 
430 aa  50.4  2e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  23.19 
 
 
430 aa  50.4  2e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  25 
 
 
420 aa  48.9  7e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  22.45 
 
 
426 aa  48.9  8e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  23.74 
 
 
425 aa  45.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>