233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0048 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0048  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  100 
 
 
759 aa  1563  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1054  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.7 
 
 
746 aa  788  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2571  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.63 
 
 
775 aa  868  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0351  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.09 
 
 
789 aa  923  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.478958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0702  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.33 
 
 
769 aa  911  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.99094e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2252  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.86 
 
 
618 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00612019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3711  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.58 
 
 
619 aa  613  1e-174  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0130664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1604  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.34 
 
 
618 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.79053e-05  hitchhiker  2.12198e-07 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.34 
 
 
618 aa  607  1e-172  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.98 
 
 
619 aa  608  1e-172  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00561072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3310  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.74 
 
 
618 aa  603  1e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3663  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.54 
 
 
618 aa  604  1e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0424871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.89 
 
 
618 aa  603  1e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000577057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3398  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.54 
 
 
618 aa  604  1e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3614  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.89 
 
 
618 aa  603  1e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.58287e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.89 
 
 
618 aa  604  1e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.13907e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1260  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.27 
 
 
798 aa  593  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.14 
 
 
670 aa  582  1e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0127  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  42.52 
 
 
736 aa  581  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3590  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  45.32 
 
 
720 aa  562  1e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.38 
 
 
676 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2830  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.18 
 
 
705 aa  494  1e-138  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2516  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.05 
 
 
705 aa  492  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  53.72 
 
 
1197 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1468  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  32.43 
 
 
708 aa  350  8e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.897136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1540  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  32.13 
 
 
705 aa  340  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0445  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.12 
 
 
706 aa  339  1e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3773  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.83 
 
 
712 aa  336  7e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04070  hypothetical protein  30.83 
 
 
712 aa  336  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4846  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.96 
 
 
712 aa  336  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4492  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.83 
 
 
712 aa  336  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.83 
 
 
712 aa  336  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5758  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.7 
 
 
712 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3756  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  30.83 
 
 
712 aa  336  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4798  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.69 
 
 
712 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.7 
 
 
712 aa  335  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.7 
 
 
712 aa  335  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4734  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.69 
 
 
712 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.715295  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4832  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.69 
 
 
712 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4853  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.69 
 
 
712 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241457  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2834  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.1 
 
 
705 aa  332  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4703  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.56 
 
 
712 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1687  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.48 
 
 
705 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.673685  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1665  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.35 
 
 
705 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.92 
 
 
712 aa  332  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.48 
 
 
705 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837695  hitchhiker  0.000803625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1650  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.48 
 
 
705 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2603  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.35 
 
 
705 aa  330  5e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  5.97359e-05 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05713  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.51 
 
 
706 aa  329  1e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2511  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.35 
 
 
705 aa  329  1e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2441  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.23 
 
 
705 aa  328  2e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0437  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.43 
 
 
712 aa  327  4e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1275  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.62 
 
 
705 aa  327  4e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198508 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000107  ribonucleotide reductase of class III (anaerobic) large subunit  31.26 
 
 
706 aa  326  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.21 
 
 
712 aa  323  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2619  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.36 
 
 
705 aa  320  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0791  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.21 
 
 
706 aa  320  7e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4035  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.26 
 
 
712 aa  319  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1419  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.39 
 
 
704 aa  319  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3691  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.26 
 
 
712 aa  319  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3556  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.26 
 
 
712 aa  319  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0525  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.7 
 
 
712 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0740  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  32.25 
 
 
704 aa  317  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1600  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.15 
 
 
705 aa  316  1e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0417  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.18 
 
 
712 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3049  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.41 
 
 
705 aa  312  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0131887  normal  0.0662102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3748  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.22 
 
 
712 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.71 
 
 
705 aa  310  7e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  3.41195e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2443  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.83 
 
 
705 aa  300  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1125  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.84 
 
 
805 aa  298  4e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2086  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.38 
 
 
723 aa  293  6e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.37 
 
 
747 aa  290  7e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1942  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.42 
 
 
734 aa  289  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1929  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.88 
 
 
802 aa  288  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2183  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.27 
 
 
616 aa  285  2e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21480  ribonucleoside-triphosphate reductase class III catalytic subunit  28.09 
 
 
754 aa  283  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0138  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.3 
 
 
738 aa  281  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.450422 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1116  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.32 
 
 
733 aa  280  5e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.287436  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2300  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.5 
 
 
765 aa  280  9e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2694  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.09 
 
 
616 aa  271  3e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1317  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.29 
 
 
744 aa  271  3e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2640  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.09 
 
 
616 aa  271  3e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1539  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.58 
 
 
736 aa  266  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.854468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.07 
 
 
708 aa  260  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1233  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.18 
 
 
704 aa  255  2e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04760  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.8 
 
 
737 aa  233  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.496041  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02440  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.87 
 
 
740 aa  231  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.187193  normal  0.336585 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1001  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.59 
 
 
706 aa  230  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.64 
 
 
740 aa  219  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.45 
 
 
791 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.94 
 
 
768 aa  191  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.05 
 
 
791 aa  190  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.45 
 
 
791 aa  190  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1190  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.86 
 
 
690 aa  164  8e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.629609 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1041  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.16 
 
 
1225 aa  152  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.588089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.32 
 
 
813 aa  150  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.8 
 
 
695 aa  148  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.25 
 
 
692 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.42 
 
 
715 aa  143  1e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.81 
 
 
695 aa  143  1e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>