220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0742 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  100 
 
 
339 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  56.84 
 
 
340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  46.36 
 
 
353 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.36 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  45.45 
 
 
346 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  43.37 
 
 
355 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  44.15 
 
 
346 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  43.86 
 
 
346 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  44.71 
 
 
346 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  43.57 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  46.11 
 
 
349 aa  258  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  43.99 
 
 
346 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  43.6 
 
 
343 aa  255  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  44.61 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  44.19 
 
 
343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  43.7 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  43.73 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  46.43 
 
 
347 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  43.8 
 
 
346 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  44.51 
 
 
351 aa  252  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  44.05 
 
 
348 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  43.8 
 
 
346 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  43.31 
 
 
348 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  43.52 
 
 
346 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  46.33 
 
 
348 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  45.38 
 
 
350 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  44.09 
 
 
353 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  44.87 
 
 
346 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  43.15 
 
 
346 aa  248  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  44.87 
 
 
346 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  41.79 
 
 
346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  45.37 
 
 
345 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  43.9 
 
 
343 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  43.36 
 
 
361 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  43.36 
 
 
371 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  42.77 
 
 
361 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  43.11 
 
 
364 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  43.71 
 
 
348 aa  225  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  39.58 
 
 
362 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  42.09 
 
 
347 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  44.21 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  39.7 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  42.9 
 
 
341 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  40.24 
 
 
338 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  36.42 
 
 
349 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  39.23 
 
 
339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  39.54 
 
 
349 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  38.3 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  40.83 
 
 
341 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  37.21 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  36.92 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1169  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.41 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.72 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  34.4 
 
 
346 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.01 
 
 
356 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  37.46 
 
 
350 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  45.69 
 
 
353 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  37.87 
 
 
351 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  34.59 
 
 
355 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  39.31 
 
 
351 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  38.44 
 
 
353 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  37.97 
 
 
343 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  40.47 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  39.64 
 
 
352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  37.14 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  37.46 
 
 
362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  38.29 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  40.97 
 
 
345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  42.06 
 
 
341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  38.84 
 
 
336 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  34.23 
 
 
350 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  36.68 
 
 
353 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  33.05 
 
 
352 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  36.1 
 
 
365 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  34.62 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  34.76 
 
 
349 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  38.82 
 
 
375 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  39.25 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  37.04 
 
 
357 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  38.14 
 
 
387 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  36.81 
 
 
369 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  34.19 
 
 
348 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  39.02 
 
 
352 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  33.9 
 
 
349 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  34.58 
 
 
348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  34.82 
 
 
350 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3029  threonine aldolase  35.94 
 
 
357 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  28.99 
 
 
341 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  40.48 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1377  hypothetical protein  27.54 
 
 
351 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1404  hypothetical protein  27.54 
 
 
351 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.265494  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  29.89 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  36.92 
 
 
358 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  36.92 
 
 
358 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  30.95 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  36.63 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  31.04 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.09 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  37.4 
 
 
357 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2927  Threonine aldolase  35.38 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>