17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6191 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  60.62 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  37.73 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  31.02 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  33.59 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  33.99 
 
 
264 aa  85.1  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  34.43 
 
 
298 aa  85.1  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  39.74 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  32.57 
 
 
280 aa  82  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1902  hypothetical protein  33.85 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  29.39 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  35 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  33.9 
 
 
356 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0574  hypothetical protein  34.43 
 
 
358 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  29.3 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  25.86 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  30.97 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>