70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4102 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  65.96 
 
 		 97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  56.12 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  57.14 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  55.43 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  52.81 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  51.55 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  55.56 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  49.44 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  45.83 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  47.31 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  57.89 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  45.56 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  47.87 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  48.61 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  41.76 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  34.83 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  44.09 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  43.04 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  33.33 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  48.39 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  38.96 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  36.26 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03040  hypothetical protein  60 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  42.55 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  37.08 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  40.45 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  45.74 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  30.68 
 
 		 326 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  35.35 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  35.9 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 303 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  28.41 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  35.87 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  35.9 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  34.29 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  34.78 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 332 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  32.98 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  31.91 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 		 325 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  31.03 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  26.44 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0476  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>