38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1111 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  63.73 
 
 		 210 aa  258  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  64.29 
 
 		 210 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  65.55 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  61.34 
 
 		 201 aa  235  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  66.49 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  65.98 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  54.08 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  55.5 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  56.02 
 
 		 197 aa  194  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  56.02 
 
 		 197 aa  194  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  56.02 
 
 		 197 aa  194  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  52.88 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  38.07 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  35.75 
 
 		 200 aa  95.9  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  37.74 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 142 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 472 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 171 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5282  hypothetical protein  29.57 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3725  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  0.384305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  44 
 
 		 118 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  25 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>