31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0827 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0827  PilT protein domain protein  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  54.62 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  50.77 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3973  high-affinity nickel permease-like protein  42.39 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0271178  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0926  hypothetical protein  36.22 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  27.64 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  30.7 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  29.67 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  24.78 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5182  PilT domain-containing protein  29.06 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  24.58 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  25.64 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  36.19 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  24.14 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  25.58 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  24.58 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  31.4 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  24.14 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  24.58 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  22.88 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  29.37 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  24.18 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  25.66 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  31.25 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1840  PilT domain-containing protein  26.32 
 
 		 135 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4257  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  hitchhiker  0.000155832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  31.75 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  29.9 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  45.45 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  22.41 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>