46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0399 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  353  8.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  36.93 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  36.93 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  35.53 
 
 		 182 aa  97.4  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  29.95 
 
 		 196 aa  95.5  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  35.39 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  33.97 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  34.59 
 
 		 193 aa  91.3  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  33.12 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  31.98 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  32.35 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  33.52 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  31.58 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  31.58 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  31.98 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  32.43 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  32.54 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  32 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  31.58 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  32.08 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  30.92 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  31.33 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  29.61 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  31.33 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  32.67 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  28.96 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  28.95 
 
 		 206 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  31.65 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  28.22 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  26.19 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  26.01 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  27.1 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  26.19 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  26.8 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  26.49 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  30.87 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  29.3 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  25.64 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  29.75 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  27.7 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  26.42 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  24.86 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  39.39 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>