181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0974 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  100 
 
 
546 aa  1122    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  59.27 
 
 
549 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2847  2-keto-3-deoxygluconate permease  63.25 
 
 
502 aa  704    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  53.01 
 
 
541 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  53.55 
 
 
568 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  52.82 
 
 
568 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  52.68 
 
 
553 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  51.92 
 
 
542 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  51.29 
 
 
535 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  49.74 
 
 
565 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  53.51 
 
 
533 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  53.51 
 
 
533 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  52.55 
 
 
542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  52.52 
 
 
547 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  51.29 
 
 
532 aa  570  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  52.58 
 
 
533 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  51.67 
 
 
566 aa  569  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  51.82 
 
 
542 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  51.97 
 
 
549 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  51.8 
 
 
548 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  51.93 
 
 
539 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  51.65 
 
 
533 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  52.15 
 
 
550 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  50.28 
 
 
537 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  52.11 
 
 
531 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  52.03 
 
 
531 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  51.01 
 
 
537 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  50 
 
 
526 aa  546  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  51 
 
 
531 aa  538  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  50.73 
 
 
522 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  49.55 
 
 
555 aa  538  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  51.43 
 
 
549 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  48.19 
 
 
525 aa  535  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  49 
 
 
549 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  50.98 
 
 
549 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  49.63 
 
 
542 aa  528  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  46.22 
 
 
557 aa  524  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  49.45 
 
 
547 aa  522  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  46.46 
 
 
549 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01080  hydroxylamine reductase  49.91 
 
 
520 aa  520  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.626709  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  47.56 
 
 
551 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  46.4 
 
 
568 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  49.37 
 
 
555 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  46.95 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  47.6 
 
 
545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  45.96 
 
 
553 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  46.65 
 
 
552 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  45.6 
 
 
545 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  46.08 
 
 
544 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  46.69 
 
 
554 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  45.42 
 
 
545 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  46.58 
 
 
552 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  45.88 
 
 
557 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  46.99 
 
 
547 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  46.4 
 
 
552 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  45.7 
 
 
554 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  46.32 
 
 
554 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  47.61 
 
 
554 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  47.9 
 
 
621 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  47.44 
 
 
543 aa  507  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  45.88 
 
 
556 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  46.99 
 
 
547 aa  505  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  45.96 
 
 
554 aa  505  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  45.96 
 
 
554 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  45.96 
 
 
554 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  45.6 
 
 
554 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  45.96 
 
 
554 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  45.6 
 
 
554 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  46.4 
 
 
538 aa  500  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  45.7 
 
 
554 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  44.86 
 
 
565 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  45.62 
 
 
554 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  46.06 
 
 
554 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  47.06 
 
 
553 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  45.44 
 
 
546 aa  495  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  45.47 
 
 
555 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  45.5 
 
 
552 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  47.39 
 
 
552 aa  496  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  47.17 
 
 
546 aa  495  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  46.7 
 
 
539 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  46.5 
 
 
562 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  46.59 
 
 
549 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  45.13 
 
 
550 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  45.31 
 
 
550 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  46.43 
 
 
559 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0716541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  45.13 
 
 
550 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  45.13 
 
 
550 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  44.95 
 
 
550 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  44.95 
 
 
550 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  45.96 
 
 
550 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  44.95 
 
 
550 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  44.95 
 
 
550 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  44.95 
 
 
550 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  45.13 
 
 
550 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  45.13 
 
 
550 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  44.95 
 
 
550 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  44.95 
 
 
550 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  45.13 
 
 
550 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  44.95 
 
 
550 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  43.68 
 
 
550 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>