107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0934 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  94.15 
 
 
188 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  65.24 
 
 
203 aa  264  6e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  63.3 
 
 
190 aa  261  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  61.17 
 
 
190 aa  257  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  63.3 
 
 
190 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  61.7 
 
 
189 aa  244  5e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  61.17 
 
 
189 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  66.67 
 
 
189 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  64.41 
 
 
189 aa  239  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  66.1 
 
 
189 aa  238  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.60321e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  66.1 
 
 
189 aa  238  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  65.54 
 
 
189 aa  235  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  65.54 
 
 
189 aa  235  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.13334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  65.54 
 
 
189 aa  235  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.89969e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  65.54 
 
 
189 aa  235  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  65.54 
 
 
189 aa  235  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  65.54 
 
 
189 aa  235  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.98472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  65.54 
 
 
189 aa  235  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.03709e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  64.41 
 
 
189 aa  235  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.21736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  53.85 
 
 
200 aa  218  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  54.8 
 
 
193 aa  214  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  34.76 
 
 
326 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  35.96 
 
 
290 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.98818e-07 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  36.41 
 
 
310 aa  126  2e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  35.47 
 
 
294 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  34.98 
 
 
292 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  34.98 
 
 
292 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  34.98 
 
 
292 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  34.98 
 
 
292 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  34.98 
 
 
292 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  36.72 
 
 
421 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  35.47 
 
 
290 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  34.48 
 
 
291 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  38.42 
 
 
230 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  38.42 
 
 
249 aa  121  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  33.5 
 
 
296 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  38.67 
 
 
230 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  35.59 
 
 
277 aa  121  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  33.5 
 
 
300 aa  120  1e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  35.94 
 
 
304 aa  119  2e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  35.94 
 
 
304 aa  119  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  34.43 
 
 
324 aa  120  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  35.94 
 
 
301 aa  119  2e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  34.48 
 
 
303 aa  119  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  36.61 
 
 
224 aa  119  2e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  33.99 
 
 
293 aa  118  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  33 
 
 
298 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  33 
 
 
298 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  33 
 
 
314 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  34.38 
 
 
308 aa  116  2e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  33.85 
 
 
301 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  36.16 
 
 
245 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  33.5 
 
 
291 aa  115  4e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  36.11 
 
 
260 aa  115  4e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  34.48 
 
 
293 aa  115  4e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  34.46 
 
 
276 aa  112  2e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  33.86 
 
 
231 aa  111  8e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.26374e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  35.03 
 
 
231 aa  110  1e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  37.1 
 
 
286 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  36.88 
 
 
227 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  35.62 
 
 
228 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  3.43768e-09 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  35.2 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  29.38 
 
 
270 aa  96.7  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  31.28 
 
 
301 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  32.97 
 
 
302 aa  94.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  28.88 
 
 
287 aa  91.3  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  31.79 
 
 
289 aa  90.1  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  30.05 
 
 
290 aa  88.6  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  28.71 
 
 
316 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  28.96 
 
 
290 aa  88.2  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  30.73 
 
 
292 aa  88.2  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  29.95 
 
 
308 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  31.25 
 
 
284 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1481  manganese containing catalase  31.95 
 
 
184 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000413774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  28.43 
 
 
285 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  28.43 
 
 
285 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  28.43 
 
 
285 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  27.64 
 
 
303 aa  85.1  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  27.92 
 
 
285 aa  82  5e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  28.57 
 
 
297 aa  81.6  6e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  28.02 
 
 
275 aa  80.1  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  26.4 
 
 
295 aa  78.6  5e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  28.02 
 
 
274 aa  78.6  5e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  28.02 
 
 
274 aa  76.3  3e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  26.5 
 
 
321 aa  67.8  8e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  25.52 
 
 
287 aa  67  2e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  25.52 
 
 
284 aa  66.6  2e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  26.04 
 
 
308 aa  66.2  2e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  25 
 
 
287 aa  65.9  3e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  25 
 
 
284 aa  65.9  3e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  25 
 
 
284 aa  65.9  4e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  25.15 
 
 
298 aa  63.2  2e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  1.23231e-11 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  27.33 
 
 
297 aa  62.4  4e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  25.77 
 
 
298 aa  61.2  7e-09  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2783  manganese containing catalase  28.57 
 
 
296 aa  59.7  2e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00681002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  25 
 
 
249 aa  58.9  4e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  27.78 
 
 
304 aa  58.2  8e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  25.41 
 
 
302 aa  56.6  2e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  24.84 
 
 
294 aa  56.2  2e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>