216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2183 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  100 
 
 
320 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  95.31 
 
 
320 aa  617  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  50.31 
 
 
315 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  40.57 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  40.13 
 
 
311 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  39.12 
 
 
311 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  38.99 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  37.97 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  36.79 
 
 
307 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  38.36 
 
 
315 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  30.35 
 
 
444 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  31.66 
 
 
311 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  31.56 
 
 
399 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  29.53 
 
 
429 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  27.99 
 
 
342 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  34.33 
 
 
328 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  32.9 
 
 
307 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
348 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  31.02 
 
 
344 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  34.15 
 
 
342 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  28.66 
 
 
400 aa  152  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  35.61 
 
 
307 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  33.74 
 
 
352 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  32.35 
 
 
307 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  33.33 
 
 
352 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  34.73 
 
 
307 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  29.19 
 
 
344 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  28.49 
 
 
444 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  34.29 
 
 
307 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  26.45 
 
 
412 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  30.88 
 
 
315 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  29.01 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  28.66 
 
 
433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  32.93 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  28.53 
 
 
419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  32.64 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  33.76 
 
 
307 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  33.44 
 
 
307 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  33.61 
 
 
350 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.11 
 
 
602 aa  146  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  28.05 
 
 
399 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  30.18 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  33.12 
 
 
307 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  33.12 
 
 
307 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  33.44 
 
 
307 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  31.93 
 
 
353 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  33.12 
 
 
307 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  32.48 
 
 
307 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  29.15 
 
 
438 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  30.6 
 
 
349 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  30.6 
 
 
349 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  30.36 
 
 
402 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  29.6 
 
 
342 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  25.7 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  32.8 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  31.87 
 
 
297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  25 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  30 
 
 
345 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  24.93 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  26.17 
 
 
412 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  32.33 
 
 
317 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  28.84 
 
 
307 aa  138  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  25.75 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  25.75 
 
 
346 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.51 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  25.78 
 
 
363 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  28.99 
 
 
349 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  25.9 
 
 
418 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  27.1 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  28.39 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  29.36 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  29.41 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  25.78 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  28.04 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  24.52 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  24.52 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0326  peptidase M19 renal dipeptidase  28.78 
 
 
323 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  30.04 
 
 
323 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  26.61 
 
 
388 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  24.78 
 
 
390 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  26.67 
 
 
359 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  26.2 
 
 
381 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  26.74 
 
 
394 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  29.67 
 
 
323 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  29.67 
 
 
323 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  29.67 
 
 
323 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  29.3 
 
 
323 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  28.21 
 
 
323 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  25.85 
 
 
338 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  32.85 
 
 
357 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  28.57 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  28.57 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  28.21 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  27.27 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  27.47 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  27.47 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  27.47 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  27.47 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  27.47 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  27.47 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>